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重磅！布魯克宣布收購IP2蛋白質組學軟件

2020.10.01

　　2020年9月30日，布魯克對外宣布最近收購了IP2（Integrated Proteomics Pipeline）搜索引擎和蛋白質組學工作流程軟件平臺。IP2搜索引擎由美國Scripps研究所John Yates III教授與Robin Park、Tao Xu博士共同創立Integrated Proteomics Applications Inc公司開發，交易的財務細節暫未下透露。

　　產品亮點

　　基于GPU計算的IP2 （Integrated Proteomics Pipeline）為4D-蛋白質組學提速

　　IP2專為timsTOF?蛋白質組學平臺打造”Run&Done”實時數據庫檢索功能

　　IP2為基于GPU計算的蛋白質組學搜索引擎，通過此次收購，進一步增強了布魯克支持CCS識別的4D-Proteomics?工作流程，基于GPU計算可大幅提高數據處理速度，更充分的利用分子CCS（碰撞截面積）信息，這能在多個方面為“shot-gun”蛋白質組學流程帶來提升，比如可以為定量蛋白質組學帶來更好的數據完整性，提高蛋白質和PTM鑒定和定量的可靠性。布魯克的新型timsTOF質譜系統在PASEF模式下有超過 120 Hz掃描速度和近100%的離子利用率，特別適合使用GPU在多線程并行操作中進行實時數據庫搜索。

基于GPU計算的IP2將數據處理速度提升百倍

　　布魯克生命科學質譜執行副總裁Rohan A. Thakur博士說：“與IP2團隊和John Yates實驗室合作是增強布魯克生物信息學和4D-蛋白質組學功能的絕佳機會。高通量蛋白質組學要求搜索引擎具有前所未有的性能，其中包括降低大數據的錯誤發現率，這將造福蛋白質組學研究和轉化醫學研究社區。我們也很高興地宣布，在加利福尼亞州圣迭戈成立了以蛋白質和數據科學為重點的布魯克生物信息學團隊，該團隊由Robin Park領導。Robin將繼續與John Yates實驗室密切合作，與布魯克開放蛋白質組學軟件的合作伙伴共同開發新功能。”

　　“我們非常高興與布魯克合作，共同建立支持CCS的生物信息學平臺”John Yates教授補充道。“還有些生物學問題質譜還不能回答，創新的軟件工具是解決這些問題的必要條件。timsTOF Pro的離子淌度功能和穩定性為Bottom-Up蛋白質組學帶來獨特的能力，可用于更多未知疾病研究。例如，我們當前的研究重點是加深我們對與腦部疾病有關蛋白質的了解，包括阿爾茨海默氏病（AD）和自閉癥譜系障礙（ASD）等。”

　　布魯克蛋白質組學副總裁Gary Kruppa博士說：“ timsTOF迎來了快速納升LC（nano-LC）時代，每個儀器、每天可分析超過50個4D-Proteomics?樣品，但現在的瓶頸是數據分析。通過獨特的IP2搜索引擎，人們能夠在大數據中對海量數據進行搜索，使用'Run＆Done'實時功能，在獲取大數據集后立即提供蛋白質組的結果。此外，借助IP2，我們希望能夠建立一種新的模式，將timsTOF采集、搜索結果作為實時反饋信息，迅速獲得目標蛋白質完整的定量結果。最后，IP2為我們的其他蛋白質組學軟件合作伙伴提供了一個接口，縮短他們的獲取檢測結果的時間。”

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布魯克

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