譚敏佳：色譜質譜雙翼護航 助力蛋白質組學新突破
分析測試百科網訊 2021年9月23日，賽默飛雙重新品線上直播發布會召開，重磅推出了Thermo Scientific? TSQ? Plus 三重四極桿質譜儀和Vanquish Neo UHPLC 系統，為蛋白質組學、精準醫學、制藥和生物制藥、臨床研究、轉化研究等領域提供了從色譜到質譜的高效、高通量、高分析性能的產品。在新品發布會上，中國科學院上海藥物研究所研究員、博士生導師、課題組長譚敏佳接受了現場采訪，分享了在蛋白質組學和翻譯后修飾方面的研究進展。
中國科學院上海藥物研究所研究員、博士生導師、課題組長譚敏佳
質譜技術助力蛋白質組學和翻譯后修飾研究
譚敏佳研究員目前擔任中國科學院上海藥物研究所的課題組長，其實驗室主要以腫瘤和代謝性疾病為研究對象，利用最新生物質譜技術，圍繞細胞內蛋白翻譯后修飾及動態變化開展研究工作，旨在發現其在疾病中的調控機制，闡明相關藥物的靶標和分子機理，鑒定“精準”指征藥效的個性化生物標志物和探索治療新策略。
譚敏佳介紹道：“目前，我們實驗室主要從事基于質譜技術的蛋白質組學和蛋白質翻譯后修飾的研究。具體來說，我們實驗室主要圍繞著細胞、動物以及臨床樣本進行大規模地蛋白質組學和蛋白質翻譯后修飾組學的分析，進行系統地分子分型、研究病理的生發展機制以及鑒定相應個性化治療的新策略。”
復雜微量樣本的組學研究：納升液相之關鍵作用
在蛋白質組學的研究中，色譜和質譜儀器發揮了重要作用，其中納升液相色譜極其關鍵。譚敏佳強調：“對于蛋白質組學的樣本來說，因為樣本極其復雜和微量，色譜技術本身和質譜技術一樣都占據了核心和不可替代的主導作用。僅采用質譜技術還不足以分離解析如此復雜的微量樣本，必須要結合串聯的色譜技術、串聯的液質聯用技術才能夠最有效地進行復雜的蛋白質樣本的分離、分析、定性和定量研究。我相信這也是我們蛋白質組學領域將來發展方向，是重要技術突破的領域。”
《Cell》 ：構建基于多維蛋白質組學的肺腺癌分子全景圖譜
2020 年 7 月 9 日，國際頂尖學術期刊 Cell 在線發表了由中國科學家完成的大規模臨床肺腺癌蛋白質組草圖的繪制工作。中國科學院上海藥物研究所譚敏佳研究員團隊，軍事科學院軍事醫學研究院、國家蛋白質科學中心（北京）賀福初院士團隊、汪宜研究員團隊，國家癌癥中心/中國醫學科學院腫瘤醫院程書鈞院士、肖汀研究員團隊，上海交通大學李婧教授等團隊聯合研究并發表，構建了基于多維蛋白質組學的肺腺癌分子全景圖譜，發現早期肺腺癌的蛋白生物學特征及相關信號通路，繪制了肺腺癌疾病的分子亞型及各亞型的分子特征與臨床表征。這項研究還揭示了不同亞型間的蛋白質表達、激酶活性、磷酸化蛋白修飾以及臨床信息等方面的特征，篩選到若干肺腺癌潛在預后標志物及潛在藥物靶標，為肺腺癌的精準醫療提供了重要資源和線索。這也是國際上首次對肺腺癌開展了大規模、高通量、系統性的全景蛋白質組學研究。
對于這項重大研究成果，譚敏佳表示：“使用質譜技術分析大規模臨床樣本的蛋白質組以及翻譯后修飾組的特征，越來越成為腫瘤精準治療領域的研究熱點。從學科發展的方向來說，我相信未來將陸續有更多更有影響力、更重磅的研究工作發表。而相較于大規模基因組技術在臨床樣本中的應用，蛋白質組學技術尚有很多繼續改進的空間，需要我們持續探索。”
蛋白質組大隊列研究的三大突破方向
對于蛋白質組學在大數據、大隊列研究的未來發展方向，譚敏佳提出了在微量分析、技術提升和信息整合三大方面的期許。
第一，如何更好地進行微量的臨床樣本的蛋白質組分析，是亟需技術突破的方向。
第二，進行大規模、大隊列分析對整個蛋白質組學系統提出更高要求，需要更高靈敏度、更高通量、更高重現性的分析測試體系。從技術角度來說，這也是重要的臨床蛋白質組學發展的方向。
第三點也是非常關鍵的是，如何進行大規模大數據整合的分析，包括蛋白質組和修飾、蛋白質組和基因組之間的整合分析等。這些生物信息學手段還需要更有效的方法學發展。
譚敏佳表示：“在我自己更關注的蛋白翻譯后修飾研究方向中，實際上對臨床樣本的蛋白翻譯后修飾的定性定量也是非常具有挑戰性的。近幾年來磷酸化組學分析方面已經取得顯著進展，但其它的翻譯后修飾如乙酰化、泛素化等，在臨床樣本的分析方面目前還有很多技術難度。希望今后若干年里出現更好的技術進展。”
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