用離散量的方法識別蛋白質的超二級結構

摘要：用離散量的方法，對2208 個分辨率在2.5I 以上的高精度的蛋白質結構中四類超二級結構進行了識別。從蛋白質一級序列出發，以氨基酸（ 20 種氨基酸加一個空位） 和其緊鄰關聯共同為參數，當序列模式固定長取8 個氨基酸殘基時，對“ 822”序列模式3 交叉檢驗的平均預測精度達到78.1%，jack-knife 檢驗的平均預測精度達到76.7%；當序列模式固定長取10 個氨基酸殘基時，對“ 1041”序列模式3 交叉檢驗的平均預測精度達到83.1%，jack-knife 檢驗的平均預測精度達到79.8%。