應用蛋白質組學方法篩選結腸癌相關蛋白質

摘要: 目的　通過比較結腸癌組織與癌旁正常腸組織的差異表達蛋白譜, 以期發現結腸癌癌變相關蛋白。方法　將結腸癌組織與癌旁正常結腸組織蛋白進行雙向凝膠電泳, 選擇在癌組織中高表達的50 個點進行MALD I2TO F 質譜分析和生物信息學分析。W estern B lo t 和免疫組化方法驗證蛋白的差異表達。結果　建立了結腸癌及正常腸組織的雙向凝膠電泳圖譜, 其中癌旁正常結腸組織和結腸癌組織電泳圖譜中平均蛋白質點數分別為860±45和980±28; 癌旁正常結腸組織和結腸癌組在IEF 方向上的平均偏差分別為(01487±0111)mm 和(01654±0111)mm , 在SDS2PA GE 方向上的平均偏差分別為(01944±0112)mm 和(1120±0122)mm , 結腸癌與癌旁正常結腸組織的差異表達蛋白質點數為72100±12134。選擇在癌組織中高表達的50 個點進行質譜分析和生物信息學查詢, 鑒定了其中有意義的25 個點, 包括谷胱苷肽S 轉移酶、肝脂肪酸結合蛋白、熱休克蛋白27 等。免疫組化方法檢測結腸癌組織芯片中GST 和HSP27 的表達, 結果顯示, GST 在結腸癌中表達的陽性率為7317% , 在正常腸黏膜中表達的陽性率為2816% , 差異有顯著性(P < 0101) ; HSP27 在結腸癌中表達的陽性率為7317% , 在正常腸黏膜中表達的陽性率為2114% , 差異有顯著性(P < 0101)。結論　蛋白質組學方法較好地顯示結腸癌組織和癌旁正常組織的差異表達蛋白; 其中在結腸癌組織中高表達蛋白HSP27 和GST 可能作為結腸癌診斷標志物。