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    • 利用蛋白質相互作用關系改善基因芯片缺失數據估計的精度

    上一篇 / 下一篇  2008-11-03 22:10:24/ 個人分類：蛋白質

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    摘要: 針對基因芯片數據缺失問題, 利用蛋白質相互作用關系與基因表達的內在聯系, 提出了一種利用蛋白質相互作用信息提高基因芯片缺失數據估計精度的方法. 將蛋白質間的相互作用關系與基因表達數據間的距離相結合來計算基因間的表達相似度, 根據這個新的相似性度量標準為含有缺失數據的基因選擇更為合適的用于估計缺失值的基因集合. 將新的相似性度量標準與傳統的KNNimpute、LLSimpute 方法相結合, 描述了對應的改進算法PPI-KNNimpute、PPI-LLSimpute. 對真實的數據集測試表明, 蛋白質相互作用信息能有效改善基因缺失數據估計的精度.



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    TAG: 基因芯片相互作用蛋白質缺失值估計

     

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