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    • 蠟狀芽孢桿菌ATCC 10987基因組蛋白質編碼基因的重新注釋與分析

    上一篇 / 下一篇  2008-11-03 21:43:13/ 個人分類：蛋白質

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    摘　要: 蠟狀芽胞桿菌ATCC 10987對于細菌比較基因組學的研究有重要意義. 但其染色體中基因的數目被RefSeq注釋為5 603個,這個注釋是有疑問的. 本文采用Zcurve和Glimmer程序聯合打分的方法來識別其蛋白質編碼基因.為保證預測結果的可靠性,對聯合判別附加預測的基因使用了BLAST方法進行數據庫同源性搜索. 結果,蠟狀芽胞桿菌ATCC 10987基因組中的蛋白質編碼基因的數目被重新確定為5 180個. 這個數目明顯低于原始注釋的數目,并且一些指標表明新的注釋更為可信. 這些相對正確的基因集合為該細菌親緣物種的深入研究提供了基礎.



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    TAG: 蛋白質細菌基因組比較基因組編碼基因

     

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