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    Nature: piRNA解釋昆蟲學界世紀問題

    關鍵詞: piRNA 非編碼RNA Nature 家蠶來源: 銳博生物

    最近,日本東京大學研究者在Nature上發表論文,公布了他們關于家蠶性別決定的最新進展。在論文中,研究者描述了他們所發現的一個piRNA—FempiRNA,并詳細闡明了該piRNA的來源及其在家蠶性別決定機制中的關鍵作用。 不同于哺乳動物,家蠶的性染色體為WZ型,雄性有兩個Z染色體,而雌性則有一個W染色體,一個Z型染色體。家蠶的性別決定是在胚胎形成早期完成的,之前的研究已經發現,W染色體決定胚胎是否會發育成雌性成蟲,但由于W染色體上幾乎完全被轉座子占據,基本上沒有任何編碼蛋白的基因,所以研究者一直未能鑒別出W染色體上決定雌性性別的基因。 本文中,研究者首先檢測了雌性和雄性家蠶胚胎的Bmdsx基因,該基因是控制家蠶性別分化的關鍵基因,可通過選擇性剪切,產生雌性和雄性所特有的mRNA,決定性別方向。

    結果表明,雌性Bmdsx在雌雄兩種家蠶的胚胎發育早期就已出現,而雄性Bmdsx只在雄性胚胎中很明顯,但雌性胚胎在發育21小時后才開始出現。這表明雌性Bmdsx在胚胎早期就一直存在,或許是由W染色體直接表達而來,而雄性Bmdsx則可能有其他調控機制,控制雄性胚胎產生。 接下來,研究者對產卵后不同時間點兩種胚胎進行RNA-Seq及RT-qPCR檢測,力圖發現在兩種胚胎發育過程中與雄性Bmdsx調控有關的轉錄本。通過分析,他們在雌性胚胎中注意到存在于W染色體上的一個非編碼序列—comp73859_c0,并認為它是一個piRNA前體。

    通過比對胚胎或卵巢piRNA,使用northern blotting,研究者在此序列轉錄本中鑒定出一個長度29nt的piRNA,并結合piRNA文庫篩選,確定這個piRNA是由W染色體性別決定區產生的。 為了確定此piRNA的功能,研究者使用piRNA抑制劑,考察早期胚胎中該piRNA對于Bmdsx基因的影響,結果發現,在使用piRNA 抑制劑處理的雌性胚胎中,出現了雄性Bmdsx,而雄性胚胎則沒有影響;使用siRNA處理piRNA作用通路的兩個核心組件Siwi及BmAgo3后,發現在沉默Siwi時,雌性胚胎會產生雄性Bmdsx,但對雄性胚胎沒有影響,而沉默BmAgo3在兩種胚胎中都不會對Bmdsx產生影響。

    這表明雌性胚胎需要此piRNA才能維持雌性Bmdsx,且Siwi對piRNA的產生是必需的,研究者將此piRNA命名為Feminizer(Fem)。 對于Fem所參與的通路,研究者鑒定了一個位于Z染色體上的一個與Fem互補的基因座—Masculinizer(Masc)。該基因通過在全Z染色體上抑制基因表達,在胚胎時期控制劑量補償和雄性化。

    通過5’RACE實驗,發現MascmRNA是FempiRNA的剪切靶點;同時,PIWI-Masc piRNA復合體也可以剪切FemRNA。另外,在RNA免疫共沉淀(RIP)中又發現FempiRNA與Siwi蛋白結合,MascpiRNA與BmAgo3蛋白結合。

    不同于FempiRNA,一定量的MascpiRNA-BmAgo3復合體在新生卵細胞中就存在,這也解釋了為什么在雌性胚胎中BmAgo3RNAi對Bmdsx沒作用。由此,研究者總結出了FempiRNA的乒乓模型,該模型由FempiRNA及MascpiRNA作為伙伴,配合Siwi及BmAgo3兩種蛋白共同組成。

    FempiRNA的產生,導致MascmRNA被剪切,產生MascpiRNA,同時產生雌性Bmdsx,且Fem piRNA對于雌性保持是必須的。

    本文闡明了一個困擾昆蟲遺傳學界將近一個世紀的問題,解釋了W染色體決定家蠶雌性特征的機制,鑒定出鱗翅目中一個主要性別決定因子—FempiRNA,確定了一個FempiRNA/Masc/Bmdsx性別決定通路,這也為piRNA介導性別決定提供了證據。piRNA作為近幾年發現的一類非編碼RNA,有著與眾不同的作用于調控機制,對于生殖調控,意義尤其重大。本文所建立的家蠶piRNA研究策略,非常具有借鑒意義,研究者靈活運用了RNAi、RNA-Seq及RIP等轉錄組學研究方法,對piRNA的功能與調控進行了多角度全方位探索。

    近期,來自中科院上海生命科學研究院的劉默芳課題組,也在Cell Research上發表論文,證實在精子發生后期粗線期piRNAs導致了大量的mRNA消失,這也是中國科學家在piRNA研究中的一項重要發現。

    在未來研究中,研究者或許可以通過RNAi等技術,特異性作用于某個piRNA或其通路中的關鍵元件,達到控制性別或其他治療作用。作為最具實力轉錄組學研究專家,銳博生物已建立了全面的RNA服務平臺、研發出優質的RNA類實驗產品,并在2013年建立起國內首條cGMP寡核酸生產線,在piRNA等轉錄組學研究領域具有豐富經驗,可為研究者提供最完善的piRNA研究策略。

    目前國內piRNA研究方興未艾,銳博生物竭誠希望,為包括劉默芳課題組在內的眾多研究者提供優秀的piRNA解決方案,助力研究者發現更多piRNA奧秘!

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