microRNA芯片應用:篩選血清血漿中腫瘤早期診斷生物標志物
microRNA是一類約22nt的小分子RNA,調控基因表達。目前有研究顯示,microRNA能以沉默復合體的形式穩定存在于人類的血清血漿中。癌癥患者由于細胞破損,會釋放一部分癌癥特異的microRNA進入循環系統中,這部分microRNA就能作為生物標志物進行腫瘤的早期診斷。
安捷倫是國際領先的生物芯片制造企業。它生產的microRNA芯片通過獨特的探針設計能區分成熟miRNA和miRNA前體,同時具有特異性高、靈敏度高等特點。特別適用于血清血漿microRNA的檢測。
Agilent microRNA芯片技術特點
1. 唯一能通過特殊的探針設計區分成熟miRNA和miRNA前體的芯片平臺;
2. 無需分離miRNA,直接用Total RNA 進行實驗,只需100ng的Total RNA 即可用來進行標記實驗(不包括質檢所消耗的量),避免了分離、富集、放大等過程帶來的影響;
3. 樣品適用范圍廣:組織、血清、血漿、FFPE、冰凍切片組織、脫落細胞等均可進行實驗;
4. 高特異性:特殊的專利探針設計能區別一個堿基的差異;
5. 高靈敏度:檢測豐度跨4個log,最高可達6個log,只要存在6000個拷貝的分子就可以檢出;
6. 數據來源于Sanger 16.0/17.0版本,并方便及時更新。
Agilent microRNA芯片更勝一籌!
日本的科學家曾經對比過市面上主要的microRNA芯片平臺(Agilent,Ambion,Exiqon,Invitrogen and Toray),結果發現Agilent的microRNA芯片具有很好的技術重復性,并且與金標準Taqman熒光定量PCR 的結果具有很好的一致性!
絕佳的技術重復性!
與Taqman熒光定量PCR結果具有很好的一致性
參考資料 Sato F, Tsuchiya S, Terasawa K, Tsujimoto G (2009) Intra-Platform Repeatability and Inter-Platform Comparability of MicroRNA Microarray Technology. PLoS ONE 4(5): e5540. doi: 10.1371/journal.pone.0005540
血清血漿microRNA檢測經典案例
一、篩選發現乙型肝癌血清血漿microRNA生物標志物
復旦大學中山醫院肝癌研究所樊嘉教授課題組使用Agilent microRNA芯片對比肝癌患者VS正常人群,肝癌患者VS慢性乙型肝炎患者,肝癌患者VS肝硬化患者的血清血漿microRNA表達譜,共完成137個樣品的microRNA芯片檢測。篩選出15個明顯差異表達的microRNA,并用RT-PCR的方法進行驗證,最終建立了一個包含7個microRNA的多指標的logistic回歸分析模型,用以區分肝癌患者和其它對照人群。這項研究成果對于肝癌的早期診斷和治療有重大意義。相關microRNA芯片技術服務由上海伯豪生物技術有限公司完成。
原文:Plasma MicroRNA Panel to Diagnose Hepatitis B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma. Journal of Clinical Oncology. November 21, 2011(影響因子18.97)
二、篩選發現血清血漿中的胃癌早期診斷標志物
生物芯片上海國家工程研究中心肖華勝博士課題組收集了7個胃癌患者、7個結腸癌患者和10個正常個體的血清樣品,用Agilent公司的microRNA芯片進行microRNA表達譜分析,并對芯片結果進行RT-PCR驗證。結果得到了7個在胃癌患者血清中高表達的microRNA。 隨后用qRT-PCR的方法在另外收集的樣品中對這7個microRNA進行進一步驗證。發現miR-378在胃癌患者血清中特異性高表達。miR-378作為生物標志物的診斷價值較高,靈敏度達87.5%,特異性達70.73%。這一研究成果對于胃癌的早期診斷有重要意義。 相關microRNA芯片技術服務由上海伯豪生物技術有限公司完成。
原文:Genome-wide microRNA profiles identify miR-378 as a serum biomarker for early detection of gastric cancer. Cancer Letters. 2 November 2011(影響因子4.86) 上海伯豪生物技術有限公司(生物芯片上海國家工程研究中心)是Affymetrix在國內第一家認證的技術服務商,同時也是Agilent在國內唯一認證的技術服務商。為您提供穩定完善的Agilent microRNA芯片技術服務。