基于最大熵模型的蛋白質二級結構的預測

摘要　蛋白質二級結構預測是蛋白質功能預測中一個很重要的環節。我們綜合考慮了蛋白質序列中對氨基酸二級結構具有影響的因素,采用最大熵模型實現了對蛋白質二級結構的預測。將氨基酸之間的相互作用和氨基酸對于二級結構的傾向性作為特征函數,充分體現了蛋白質序列中氨基酸之間的短程和長程的相互作用的影響。最大熵模型整合了這些多源的信息,形成一個單一的概率模型。與現有的單序列預測方法相比,本文的方法取得了較高的預測準確率,預測結果表明它是一種實用的預測方法。