蛋白質二級結構序列片段的識別

摘要: 識別蛋白質二級結構片段, 實質上是從序列片段的水平上對二級結構進行預測. 用離散量的方法, 通過一系列的計算發現: 選擇氨基酸(20 種氨基酸加一個空位) 和其緊鄰關聯共同為參數, 從N 端截取固定長序列片段為6 或7 個連續氨基酸殘基時, 10 交叉檢驗平均預測精度能達到75%～ 77% , jack2knife 檢驗平均預測精度能達到72%; 當固定長序列片段為9 或10 個連續氨基酸殘基時, 10 交叉檢驗平均預測精度能達到82%～83% , jack2knife 檢驗平均預測精度能達到74%～76%.