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  • 采用柔性分子對接技術模擬蛋白質在疏水作用色譜上的保留行為

    上一篇 / 下一篇  2008-10-19 23:20:44/ 個人分類:蛋白質

    • 文件版本: V1.0
    • 開發商: 本站原創
    • 文件來源: 本地
    • 界面語言: 簡體中文
    • 授權方式: 免費
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    摘要 將蛋白質疏水作用色譜(HIC)固定相相互作用分為直接非鍵/構象作用和蛋白質表面疏水效應兩個熱力學過程, 從而定量給出了處于濃鹽析鹽水溶液中HIC 保留時間與配基/蛋白質結合自由能之間的二元線性關系. 通過ICM柔性分子對接策略及遺傳算法(GA)對27 個已知晶體結構的蛋白質與疏水配基的可能結合方式進行模擬和分析, 所得結果與實驗觀測情況吻合良好. 研究表明, 蛋白質局部疏水效應以及配基與蛋白質的非鍵/構象作用皆對HIC 色譜保留行為影響顯著, 且作用區域多集中于蛋白質表面突出部位.



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    TAG: 色譜蛋白質疏水作用柔性分子對接遺傳算法鹽溶因子

     

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