SDS法提取植物基因組DNA操作程序
【實驗目的】
學習和掌握常用基因組DNA提取方法。
【實驗要求】
1.設計所采用實驗方案并獨立完成所有實驗操作;
2.獲得高純度、完整DNA樣品。
一、原理:
利用含高濃度SDS的抽提緩沖液在較高溫度(55—65℃)條件下裂解植物細胞,使染色體離析,蛋白質變性,釋放出核酸,然后提高鹽濃度(KAc)和降低溫度(冰上保溫)的辦法沉淀除去蛋白質和多糖(在低溫條件下KAc與蛋白質及多糖結合成不溶物),離心除去沉淀后,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反復抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。
二、藥品試劑及耗材:
—— 液氮 —— 提取緩沖液:500 mmol/L NaCl, 100 mmol/L Tris-HCl ph8, 50 mmol/L EDTA ph8,10 mmol/L 2-巰基乙醇(用前加入) ---- 20% SDS ph7.2 ---- 5 mol/L KAc ---- 氯仿:異戊醇(24:1) —— 異丙醇 —— 70%乙醇
—— TE緩沖液 :10 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,PH8.0
耗材:
移液槍,15、2.0、1.5ml離心管,籃、黃、白槍頭各四套 離心管架4個,離心管盒2個,水浴泡沫8個,研缽及小藥勺8套
棉手套,薄膜手套,透明膠布,剪刀
三、操作程序
1. 將1 g植物材料于液氮速凍,然后在研缽中將其磨碎,將粉末轉至2 ml離心管中。
2. 加入1.2 ml預熱至65℃的提取緩沖液(3V),輕緩振蕩混勻,加入120μl 20%SDS(達到終濃度2%),混勻,置65℃水浴中放置30分鐘,不時顛倒混勻。
3. 加入0.45 ml 5M的醋酸鉀(1/10V),混勻,冰浴20分鐘,在10000 rpm離心20 min。需要的話,Miracloth紗布過濾除去沉淀,取上清液轉入另一離心管中。
4. 加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),輕輕顛倒混勻, 12000 rpm離心15 min。
5. 轉移上清液到另一新離心管中,加入0.7V冰預冷異丙醇,輕輕顛倒混勻,(見絲狀沉淀)-20℃放置30分鐘沉淀核酸。
6. 25℃,12000 rpm,離心10 min,收集沉淀。
7. 棄上清,70%乙醇洗兩次。