利用CTAB法提取植物基因組DNA
一、實驗原理 CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)是一種去污劑,可溶解細胞膜并能與核酸形成復合物,該復合物在高離子強度(0.7mol/L)的溶液里是可溶的,通過離心可將復合物同蛋白質、多糖類物質分開。在酚仿變性的條件下,去除殘留的CTAB和蛋白質等雜質,然后利用異戊醇或無水乙醇將DNA分子從上清溶液中沉淀出來,最后用TE溶解DNA,并加入RNA酶以去除基因組中的RNA,置于-20℃備用。因此,CTAB可以用于從大量產生粘多糖的有機體中提取核酸,例如:植物的葉片組織。 二、實驗材料及試劑
實驗材料:新鮮植物葉片。
試劑 與溶液:
CTAB提取緩沖液,Tris-飽和酚,氯仿-異戊醇(24:1),異丙醇,70%乙醇,含RNase 的TE溶液。 CTAB提取緩沖液:2%(M/V) CTAB,1.4M NaCl,100mM Tris-Cl(pH8.0),20mM EDTA,pH 8.0,2%(V/V)β-巰基乙醇(使用前加入)。 三、實驗步驟
取0.5 g 新鮮植物葉片置于研缽中,加入適量液氮,迅速研磨成均勻粉末。
將粉末移入1.5mL 離心管 ,加入800μL CTAB分離緩沖液,上下顛倒 離心管 ,混合均勻。
將盛有樣品的離心管置于65℃ 水浴 中保溫30min,其間每隔3-4min 輕搖混勻。低溫12000rpm離心5min,將上層水相轉移至新的離心管中。
加入等體積的Tris-酚和氯仿異戊醇,上下顛倒離心管,混合均勻;低溫12000rpm離心5min,將上層水相轉移至新的離心管中。
加入等體積的氯仿異戊醇上下顛倒離心管,混合均勻;低溫12000rpm離心5min,將上層水相轉移至新的離心管中。
加入0.6倍體積的異丙醇,輕輕混勻,置于-20℃沉淀30min。
低溫12000rpm離心5min去上清,加入500μL 70%乙醇洗滌沉淀,常溫12000rpm 2min,去上清,沉淀盡量干燥。
加入適量含有RNase的TE(20μL)溶解沉淀,37℃ 水浴 30min,消化RNA。
取適量基因組DNA樣品,電泳檢測。
四、注意事項
Tris -酚,氯仿和β-巰基乙醇均為有毒試劑,使用時小心,切勿接觸皮膚。
實驗材料要新鮮。
液氮研磨要充分,研磨過程中可補充液氮繼續研磨。
酚氯仿抽提時離心時間可長些,取上清時不要觸及蛋白層。