3.蛋白質組學技術平臺

本平臺由軍事醫學科學院投巨資建設， 負責人為: 張學敏, 魏開華, 楊松成。本平臺也得到了 國家863項目、國家自然科學基金和北京市科委大力資助。 最近又投入千萬余元引進超高性能混合型串聯傅立葉變換回旋共振質譜[NanoLC-Q-FT-ICR-MS]。

國家生物醫學分析中心（NCBA）蛋白質組學技術平臺始建于1997年，主要由小規模雙向電泳和第一代生物質譜（TofSpec 和Platform. II）組成。

該平臺于2001年更新為接近當年國際水平的第二代——高通量（200-300蛋白質/天）、高靈敏（fmol）、高分辨率（>10000）、高準確度（5pmol）的較完整系統，包括可同時運行12塊電泳膠的Ettan DALT twelve（Amersham）、能夠進行隨機序列分析和準確鑒定翻譯后修飾的毛細管高效液相色譜-電噴霧-四極桿飛行時間串聯質譜（CapLC Q-TOF2，Micromass）、帶有源后衰變（PSD）功能的基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜（MALDI-TOF-MS，Reflex III）和高自動化、可連續運行3840個樣品的飛行時間質譜Autoflex（Bruker）、高容量HCT離子阱質譜和三級四極Quattro電噴霧串聯質譜以及自動切膠系統SpotCutter（Bio Rad）和自動酶切系統MassPrep（Micromass）。

本平臺即將更新為第三代。它以超高性能的9.4T混合型串聯傅里葉變換回旋共振質譜為主要特征。分辨率超過140萬，準確度優于1.0ppm，可實現超高分辨、高準確度和高靈敏度的多級串聯質譜功能。該系統配備了豐富的輔助離子解離組件，可實現整體蛋白質的序列標簽分析，無須進行酶切而直接鑒定蛋白質，是研究生物標志物最有力的、最可靠的手段。

全國近400單位/課題組在此平臺上工作，課題來源包括973課題、863課題、國家自然科學基金、開發與生產等。確認了數十個全新蛋白。部分單位根據我們提供的結果成功克隆到新基因。許多課題因為本平臺支持而獲得國家、地方科技基金的資助。