丹楓節學生論壇：蛋白質組后修飾的研究

發布于2007年5月15日

本期論壇很榮幸的請到了近期回國的張國安師兄和余巍同學為大家講座。

張師兄目前在紐約大學醫學院從事疾病蛋白質組學的研究，他給大家簡介了他的磷酸化標記定量研究，主要分以下幾個方面：一是基于QToF的磷酸化蛋白SILAC標記定量研究，得到了RTK通路中的Eph受體等重要功能蛋白的上調下調信息。二是實驗流程的設計和誤差分析。張師兄的實驗分析了IP，SDS-PAGE，酶解，質譜數據分析等步驟的誤差，以及平行實驗對總體誤差的影響。張師兄的實驗表明：IP實驗和SDS-PAGE 6次平行的實驗和3次平行實驗的差異不大，酶解只做一次就可以了，另外IP和質譜數據的分析的誤差是實驗誤差的主要來源。三是用DNA maker指導SDS切膠規避蛋白含量過低帶來的切膠困難。

余巍同學從全局的角度把乙酰化蛋白的研究做了一個綜述，包括了乙酰化組蛋白和乙酰化其他蛋白的乙酰化。由于乙酰化抗體的低親和力和[14C]-CoA的放射性比較低，乙酰化蛋白的研究相對其他修飾蛋白的研究遇到了更大的困難。