基于質譜技術的計算蛋白質組學研究

中國科學  E 輯 信息科學  2006, 36(2): 222~234

孫瑞祥 1**       付    巖 1,2    李德泉1,2       張京芬1,2        王曉彪1,2       盛泉虎3    曾  嶸3       陳益強 1        賀思敏 1       高    文 1,2 (1. 中國科學院計算技術研究所,       北京 100080; 2. 中國科學院研究生院,     北京 100039; 3.中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所,              上海 200031)

摘要：蛋白質組是繼人類基因組計劃完成之后又一新興的生命科學研究對象，蛋白質組學研究細胞或組織內所有表達的蛋白質，生物質譜技術已為蛋白質組學研究產生了大規模的質譜數據；而如何從這些數據中提取和發現有關蛋白質組的重要生物學知識為計算蛋白質組學的研究提出了重大需求，如蛋白質鑒定、翻譯后修飾、定量分析，以及疾病模式的發現等。本文研究了如何應用計算技術來解決蛋白質組學研究中質譜信息處理的這幾個關鍵問題。

關鍵詞        計算蛋白質組學           質譜技術        蛋白質鑒定        算法     生物信息學