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  • 橡膠樹死皮病膠乳C2乳清差異表達蛋白質的篩選與鑒定

    上一篇 / 下一篇  2009-01-07 13:15:03/ 個人分類:蛋白質

    • 文件版本: V1.0
    • 開發商: 本站原創
    • 文件來源: 本地
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    摘要 橡膠樹死皮病( tapp ing panel dryness, TPD)在世界各橡膠種植園普遍發生,給橡膠種植業帶來嚴重的危害。為了更好地了解和闡明死皮病發生、發展的分子機制,應用雙向凝膠電泳技術(22DE)比較橡膠樹死皮株與健康株膠乳C2乳清蛋白表達的差異。采用固相pH梯度雙向凝膠電泳分離橡膠樹死皮株與健康株C2乳清的總蛋白質,凝膠經考染顯色后,用PDQuest7. 40圖像分析軟件進行比較分析,識別差異表達的蛋白質。這些點經過膠內酶切后進行基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(MALD I2TOF2MS)分析獲取肽質指紋圖譜( PMF) ,Mascot軟件搜索SW ISS2PROT和NCB Inr數據庫鑒定蛋白質。結果: (1)橡膠樹死皮株與健康株C2乳清凝膠的平均蛋白質點數分別為1075 ±35和1134 ±27,其平均匹配的點數分別為982 ±38和1008 ±22,組內圖像匹配率達91. 89%和88. 72%。(2)橡膠樹死皮株與健康株C2乳清組間的平均匹配蛋白點數為970±25。利用MALD I2TOF2MS質譜技術對40個差異明顯的蛋白點進行分析鑒定,通過查詢數據庫鑒定了27個蛋白質。建立了分辨率高且重復性較好的橡膠樹死皮株與健康株膠乳C2乳清的雙向凝膠電泳圖譜,并應用質譜技術鑒定了其中表達差異的蛋白質點,這些差異表達的蛋白質可能參與了死皮發生和發展的過程。



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    TAG: 凝膠電泳雙向蛋白質組質譜巴西橡膠樹死皮病

     

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