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  • 基于序列剖面和可及表面積的蛋白質相互作用位點的預測

    上一篇 / 下一篇  2008-12-28 21:11:05/ 個人分類:蛋白質

    • 文件版本: V1.0
    • 開發商: 本站原創
    • 文件來源: 本地
    • 界面語言: 簡體中文
    • 授權方式: 免費
    • 運行平臺: Win9X/Win2000/WinXP
    摘要: 蛋白質相互作用位點的預測對于突變設計和蛋白質相互作用網絡的重構都是至關重要的. 由于實驗確定的蛋白質復合物和蛋白質配體復合物的結構依然相當少,預測蛋白質相互作用位點的計算方法就顯得十分重要. 該文提出了一種以支持向量機為分類器,以鄰近殘基的序列剖面和可及表面積為輸入數據來預測蛋白質相互作用位點的方法. 計算結果顯示,界面殘基和非界面殘基被識別的準確率為75. 12 % ,假陽性率為28. 04 %. 與輸入數據僅有序列剖面的方法相比,界面殘基和非界面殘基被識別的準確率提高了4. 34 % ,假陽性率降低了4. 63 %.



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    TAG: 位點支持向量機相互作用蛋白質剖面

     

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