基于離散小波變換的蛋白質結構、功能與進化關系延時交叉相關分析

摘要　基于氨基酸的疏水特性, 將離散小波變換與延時交叉相關分析相結合, 提出了一種分析蛋白質結構、功能和進化關系的新方法———序列小波層次相關法. 以絲氨酸蛋白酶超家族中Tryp sin種屬為研究對象, 描述了該方法在揭示不同物種的Tryp sin蛋白質進化關系中的應用; 以蛋白質酪氨酸磷酸酶、血紅蛋白和溶菌酶為例, 采用該方法揭示了蛋白質之間功能與序列的內在關系. 該方法為非參數方法, 具有簡單、直觀、可視和可操作性強等特點, 且不需要事先知道蛋白質的結構, 僅從蛋白質的氨基酸序列出發即可比較和揭示蛋白質之間的關系.