RNA干擾是最近發現的一種功能工具。當RNA導入一個細胞時，最終會引起細胞內互補mRNA的降解，從而導致基因功能活性的阻斷。

PTGS轉錄后基因沉默（posttranscriptionalgenesilencing）；一種首先在植物中確定，然后發現在動物中也存在的現象。盡管PTGS最初被描述作一種病毒防御和轉位子沉默的內源方法，現在它已經成為一種新的令人激動的研究工具RNAi干擾。

協同抑制（Cosuppression）基因沉默的一種特殊情況，來源于轉基因的RNA與同源內源基因同時被抑制。

靜息作用（Quelling）用于在粉色面包霉菌（Neurosporacrassa）中描述協同共抑制。這個術語僅僅用來在真菌中描述沉默。

dsRNA雙鏈RNA（Double-strandedRNA）；通常指長的或者全長的RNA雙鏈。這些大的dsRNA在大多數哺乳動物細胞類型中全面啟動宿主細胞的關閉（shutdown）；隨后細胞開始降低非靶標基因的表達，最終經歷凋亡（apoptosis）。

siRNA短的（或者小的）干擾RNA(Short(orsmall)interferingRNA);哺乳動物細胞參與引起RNAi反應的21-23核苷酸的短的RNA雙鏈。

RISCRNA誘導沉默復合體（RNA-inducedsilencingcomplex）；即所推測的多蛋白復合物，將siRNA和細胞內mRNA結合到一起，激活裂解機制（可能是內切核苷酸的），釋放mRNA并進行降解。

shRNA短的發夾RNA（ShorthairpinRNA）；也稱短的干擾發夾（shortinterferinghairpin）；在體內通過RNAi降低互補序列基因的表達。

PolIII啟動子PolIII啟動子U6或者HI（PolIIIpromoter，U6orHI），通常用來驅動shRNA的產生。PolIII啟動子具有在某一確定起始位點上游啟動轉錄所需要的全部元件。

PolIII終止子PolIII終止子（PolIIIterminator）；4個或者更多個T,提供PolIII依賴的轉錄終止。

U6啟動子U6啟動子（U6promoter）一種polIII型啟動子，允許產生確定末端的小RNA（參看polIII啟動子）。

入門載體（entryvector）包含attL位點，用來克隆DNA片段的Gateway?載體。U6入門載體,pENTR?/U6，專門設計使用U6polIII型啟動子和終止子序列，RNAi靶序列克隆進入后將在哺乳動物細胞中形成shRNA。

目的載體（destinationvector）Gateway?適合的目的載體（DEST）包含attR位點，可以與入門克隆進行重組，構建表達載體。BLOCK-iT?RNAi慢病毒和腺病毒DEST載體接受來自U6入門載體的RNAi框。此外，也有在原核、酵母、昆蟲或者哺乳動物系統表達天然蛋白或者融合蛋白的DEST載體可供選擇。

LRClonase?便于attL和attR位點在LxRGateway?重組反應中進行重組的一種酶混合物，可以把DNA序列從入門載體轉移到目的載體。