基因組DNA文庫的建立
一、原理
基因組DNA 文庫包括了基因組所有順序的隨機克隆片段。一個好的基因組DNA 文庫的大小應足夠大,以便包括所有的基因DNA 順序。DNA 克隆片段也應足夠大,其中包括整個基因、連接基因及它們穩定形式所要的側翼順序。為了獲得高的克隆效率和較大的插入片段,λ噬菌體載體和質粒經常被使用構建基因組DNA
文庫。λ噬菌體文庫易于操作,噬菌體載體上有多克隆位點。λ噬菌體能容納10 -50 kb 插入DNA,載體類型應根據所要基因組DNA 片的大小和用途來選擇。
構建一個基因組DNA 文庫的基本步驟:
① 分離純化基因組DNA ;
② 切割DNA 成合適大小的片段以用于克隆;
③ 載體DNA 的制備;
④ 把基因組DNA 片段和載DNA 連接;
⑤ 包裝重組分子;
⑥ 測定入噬菌體滴度;
⑦ 擴增DNA 文庫;
⑧ 評估文的質量。
二、材料
1、培養基
LB 肉湯;LB 瓊脂平板;LB 頂層瓊脂糖。
2、緩沖液
( 1 ) TSP :
2 ml 2 mol / L Tris -HCl( pH 7.9 )
10 ml 0.1mol / L 亞精胺
10 ml 0.1mol / L 腐胺
78 ml 水
( 2) DMSO / ATP 溶液:
按順序加入下述溶液,加ATP 之前需冷卻。
85 μl 水
100 μl DMSO(二甲基亞砜)
15 ml 0.1mol / L ATP ( pH7.0)
( 3 ) SMC 溶液:由SMCA 和SMCB 新鮮配制。
( 4) SM 稀釋緩沖液:
0.1mol / L NaCl
0.01mol / L MgSO4
0.1 mol / L Tris -HCI ( pH 7.5)
3、試劑和酶
1 ) Bam HⅠ;SauⅠ;NaeⅠ
2 ) T4 DNA 連接酶
3 )λ噬菌體。
4 )宿主菌
5 )對照λDNA