瓊脂糖凝膠電泳片斷回收的常用方法20世紀70年代是一個奠定現代分子生物學的時代，1973年冷泉港實驗室的Joseph Sambrook和Phillip Sharp發明了利用瓊脂糖凝膠分離DNA 和EB染料觀測DNA 相結合的技術。現在，瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠電泳是分離、鑒定和純化核酸和蛋白質片斷的標準方法。這里首先介紹的是瓊脂糖凝膠電泳片斷回收的常用方法：

1.柱回收試劑盒：可謂目前最簡單快速的回收方法，只需要將電泳凝膠中的產物條帶切下，用溶解Buffer徹底溶解，上包埋有純化填料的純化柱，離心，再洗滌一次，離心后用洗脫緩沖液洗脫。全程不過10多分鐘，得到的產物溶液可以直接用于后繼實驗。這個方法幾乎不需要什么技巧就能得到穩定的結果，也是目前最多商品化試劑盒選擇的方法。但是這個方法不適合用于大片斷的回收。

2.玻璃奶/純化填料膠回收試劑盒：這個方法比前面的方法更為靈活，可以根據每次回收實驗時預期回收量來調整純化填料的量，使得實驗不受限于柱子的載量，也不會造成浪費。前面的操作步驟和上者一樣，將電泳凝膠的條帶切下，Buffer溶解，（區別在于這里）加入純化填料填料吸附混合，快速離心沉淀去上清，洗滌沉淀后，干燥沉淀，最后用洗脫液純化介質中吸附的片斷釋放出來，離心，取上清，就是回收的產物。

這個方法適合各種不同大小的片斷，特別是大片斷的回收，但是操作就較前者復雜一些，涉及到多次離心沉淀和取上清，有可能會誤吸了微量的沉淀；另外干燥的程度也有點技巧，干過了不好洗脫，沒干透又影響結果。后來的改進版本有將混合了純化介質后的凝膠溶解液加入到一種離心過濾柱上，這種柱子不帶純化填料，只有一層過濾膜，離心過濾后，填料在柱子里，溶液被甩掉，這樣就避免了上述的問題。

3.低熔點瓊脂糖：傳統手工操作方法之一，低熔點瓊脂糖制備凝膠，電泳后切割目的條帶，在TE溶液中65度保溫融化，用傳統的酚氯仿抽提，乙醇沉淀。這個方法需要用到酚氯仿等有機試劑，由于乙醇沉淀需時較長，現在用的人已經不多了。

想當年經費緊張的時候，低熔點瓊脂糖貴，不舍得這么浪費的，比較取巧省錢的法子就是常規瓊脂糖電泳后，在目的條帶前方挖槽，灌入低熔點瓊脂糖，凝膠后再電泳一小會兒，等條帶進入低熔點瓊脂糖區域再將那塊家伙切出來，就可以非常非常節約了。除了直接酚抽低熔點瓊脂糖凝膠，還有人用瓊脂糖酶來消化瓊脂糖凝膠，條件也相當溫和，只是那酶價格并不便宜（光那酶的成本就至少5-6塊，還不算其他的麻煩事），多數的酶只適合用低熔點瓊脂糖，問題是我不用酶也可以直接酚抽，費時間還特長，所以，并不覺得特別好用。后來據說T家的瓊脂糖酶可以用于常規瓊脂糖，前提是你有辦法在65度把那膠化了。但那需要極好的耐心。

后來有老師從美國回來了，才有機會嘗試更好的低熔點瓊脂糖――FMC（現在叫做Cambrex了）的GTG級別低熔點瓊脂糖！那才是最簡單的方法呀！洗的超級干凈的電泳槽灌膠，電泳后，直接將條帶切下65度保溫融化，就可以直接在融化的瓊脂糖―DNA 混合物中加酶進行后繼實驗――所謂的GTG就是遺傳技術級，可以在凝膠中進行各種酶反應的哦！實驗條件非常溫和，非常適合大片斷的回收。

4.透析帶電洗脫法。煩，簡直不堪回首。切下的條帶放在充滿TAE的透析帶中再電泳一段時間，讓DNA 走出凝膠，走向溶液中，再反向電泳一會兒，將附在透析帶上的DNA 趕回溶液中，取溶液部分，再用TAE洗洗袋子，合并溶液后傳統方法酚抽沉淀，那塊膠通常還要再染色看看殘留。由于綁透析帶非常難搞，只有在萬不得已的非常大的片斷時才會考慮的。也是丙烯酰胺電泳凝膠產物回收的方法之一。

后來看到以色列的一個小公司GeBA有出簡易透析管，就是將小指管兩邊各開一小窗，貼上透析膜，把膠塊放在管中再電泳。由于不需要綁透析帶，使用方便；而且管中溶液體積小，容易處理；膜的面積也小吸附也少；頓時覺得是救星。后來貌似Pierce也推出了類似的東西，買起來更方便一點。

5.DEAE纖維素膜紙片法和其他改良法。早期實驗室最常用方法之一。將DEAE纖維素膜裁成小條活化處理。電泳后在目的條帶前切一刀，將比條帶略寬的DEAE纖維素膜插入切口，不留氣泡，繼續電泳一會兒，條帶上的DNA 被膜片截留，取出膜片沖洗后轉移到離心管中加緩沖液65度保溫洗脫，直到膜上沒有DNA 了，將溶液用酚氯仿抽提沉淀。這個方法不適合做較大的DNA ，因為洗脫比較困難。

曾經常用的另一方法是在電泳膠前挖小槽，加入緩沖液，電泳一小會兒，手提紫外監視，等條帶進入槽中，還沒在另一頭上岸時停止電泳，吸出溶液酚氯仿抽提（加點甘油可降低DNA 在溶液中的移動速度，防止那邊還沒全部下水，這邊就已經上岸了的情況。

當然也可以挖大點的孔或者多吸幾次，反正是要沉淀的，體積大些不要緊）。不過這些方法在柱回收試劑盒推出后都漸漸要淘汰了。

畢竟比較麻煩費時間，而且回收的產物純度也不比試劑盒――前者是純化介質吸附DNA 后徹底除去溶液，經過洗滌殘留在純化介質上的雜質，最后洗脫；手工的方法多是用酚氯仿抽提溶液后乙醇沉淀，由于有些多糖沉淀屬性和DNA 相似時就容易共沉淀下來。鑒于競爭的日趨激烈,純化試劑價格逐漸向下,連核酸純化領域的頂級名牌Qiagen也開始大幅度的折扣優惠,所以,有條件還是選擇試劑盒,比自己慢慢摸索要更能節約寶貴的青春。