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  • 實驗方法> 蛋白質技術> 其他技術>Northern雜交實驗指導之四:模板DNA制備

    Northern雜交實驗指導之四:模板DNA制備

    關鍵詞: northern 雜交 實驗指導來源: 互聯網

    Northern Blotting技術專題

    A.質粒 DNA的小量提取

    試劑及其配制

    含AP的LB液體培養基

    TE緩沖液:10mmol/L Tris-HCl (pH 8.0)

    1mmol/L EDTA (pH 8.0)

    溶液I: 25mmol/L Tris-Cl (pH 8.0)

    10mmol/L EDTA

    50mmol/L 葡萄糖

    高壓滅菌15min.后,4℃貯存。

    溶液II: 0.2mol/L NaOH

    1% SDS(臨用前現配制)

    溶液III(100ml):5mol/L 乙酸鉀 60ml

    冰乙酸 11.5ml

    dH2O 28.5ml

    4℃貯存。

    酚∶氯仿(1∶1)

    95%和70%乙醇

    試驗程序

    1.在純凈工作臺上將5ml含AP的LB液體培養基加入到一10~15ml通氣良好的試管中,然后將前述經鑒定含有目的DNA片斷的轉化細菌 接種其中,37℃下振蕩培養過夜。

    2.取1.5ml培養物置于一微量離心管中,在4℃下12000rpm離心2min.,棄去上清液,使細菌沉淀盡可能干燥。

    3.將細菌沉淀重懸于100&mu;l溶液I中,劇烈振蕩后加入200&mu;l新配制的溶液II,蓋緊離心管口,將其快速顛倒5次(切勿振蕩),再加入150&mu;l在冰上預冷的溶液III,蓋緊離心管口,將其倒置后輕輕地振蕩使溶液III在粘稠的裂解物中分散均勻,再將離心管置于冰上3~5min.。

    4.在4℃下12000rpm離心5min.,將上清液移至另一離心管中。

    5.加入等量酚∶氯仿(1∶1),振蕩混勻,在4℃下12000rpm離心2min.,將上清液轉入另一離心管中。

    6.加入二倍體積95%乙醇,振蕩混勻,室溫放置20min.,在4℃下12000rpm離心5min.,小心棄去上清液,倒置將液滴除盡。

    7.用70%乙醇洗滌一次,室溫干燥10min.,用50&mu;l含20&mu;g/ml胰RNA酶(無DNA酶)的TE重新溶解質粒DNA,取1&mu;l 在含溴化乙錠的微型膠上進行電泳檢測,其余置于-20℃保存備用。

    B. 質粒DNA的線性化

    試劑及其配制

    Not I和Sal I內切酶及其相應的緩沖液

    酚∶氯仿(1∶1)

    3mol/L NaAc(pH 5.2)

    100%和70% 乙醇

    DEPC-H2O

    試驗程序

    1.在離心管中依次加入:質粒DNA 10&mu;l (1&mu;g/&mu;l)

    10×內切酶緩沖液 10&mu;l

    dH2O 80&mu;l

    Sal I或Not I 2&mu;l(10U/&mu;l)

    2.37℃保溫反應2小時以上。

    3.消化液用100&mu;l的酚∶氯仿(1∶1)、氯仿各抽提一次,每次在在4℃下12000rpm離心5min.

    4.將上清液轉入一新的離心管中,加入0.1倍體積3mol/L乙酸鈉和2倍體積乙醇沉淀過夜。

    5.4℃下12000rpm離心20min.,棄去上清液,沉淀用70%乙醇洗滌一次,真空干燥。

    6.線性化質粒DNA按0.25&mu;g/&mu;l的濃度重懸于DEPC-H2O中,取10&mu;l電泳檢測線性化質量,其余于-20℃下保存備用。

    推薦方法

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