轉載:如何在頂級科學雜志上發表論文
上一篇 / 下一篇 2010-06-01 11:17:05/ 個人分類:樂觀心態
我是上醫的校友,80年代中期在上醫,然后出國多年,很慚愧到上醫的機會很少,跟大家沒有太多的交流。
今天我講的題目不太容易講,第一是本人工作做得也不是非常好,第二是大家對我的期望也過分高了一點,好像來參加我的講演,就可以在很好的雜志上發表文章,如果有這種期望,我很抱歉,做不到。在講課前我先問大家一個問題,在座的有多少人已經在英文雜志上發表過文章(課堂上回答發表過的人很少)? 看來相當少,這也難怪,很多學生剛剛進入課題,也許是來湊湊熱鬧, 看看魯白是個什么樣的怪物,沒有關系,反正我是來獻丑了 (笑) 。
要寫好的文章,最重要問題的不是英文,也不是寫作的技巧,而是要有好的科學。研究工作做得好這是最重要的。有一個錯誤的印象,認為只要我寫得好,就可以發表在好的雜志上,這是不對的。要發表好的文章,是非常非常困難的一件事情,最主要的因素是一定要有一流的工作。所以今天我借這機會,主要講的不是怎樣寫,而要怎樣才能夠做好的研究工作。首先,什么樣的研究工作是一個好的工作,大家要有一個共識。抱歉,今天我講的許多內容都是引用英文的,因為網上都有,所以不用抄,不保密,可以下載。怎樣的工作是一個好的工作其實很難用簡單的語言來概括,這是一個長期積累的工作。我認為,好的研究工作大概可以分為6~7 類:
第一,Major advance in a classic field, 假如說是一個非常經典的學科如組織胚胎學(讀醫學院的人,都要學),它已經不能再有很大進展時, 突然你有一個重大的突破,這樣的工作,應該是相當不錯的。比如說膽固醇,大家知道膽固醇一般被認為是壞東西,一個人的膽固醇要控制不能太高,因為它要造成心血管系統的疾病。但如果你突然發現膽固醇的另一個生理功效,那就很了不起。這個例子不是亂舉的,在1999 至 2001年中,連續在Science雜志上發表了三篇文章,認為膽固醇可以促進腦神經細胞突觸的形成,這就給膽固醇在生理功能的認識帶來了一個突破性的進展。你去看他們的工作,實在太簡單了,一般的實驗室都可以做,為什么大家都想不到? 一個經典的古老的學科,到了不能再有什么發展的程度時,只有從一個完全不同的角度來看問題, 才能有突破。 突然間膽固醇變成一個非常熱門的領域,今天有人認為膽固醇對神經細胞生長突觸的形成有作用,明天又有人認為膽固醇怎么樣,一下子一個古老經典的學科,有了一個突飛猛進的發展。
第二,New techniques and methods that can be widely used, 我們在做研究工作中經常會發現新的方法和技術。一個技術和方法要被非常廣泛地使用,那就是一個很好的工作,甚至可以得諾貝爾獎。PCR 技術是獲諾貝爾獎的,PCR 技術發明的當年,一下子就有幾十篇文章,后來到處都用PCR,現在已經被非常廣泛應用。不過這位發明 PCR 的人,Kary Mullis, 我覺得不怎么樣。 他從此就不干科學不干活,整天到海灘去沖浪玩。后來有人祝賀他得了諾貝爾獎,他說此獎早就該給他的了,那是題外話。事實上,應用這么廣泛的技術,你幾乎可以坐著等諾貝爾獎。還有Patch Clamp,膜片鉗技術,有了這個技術,在電生理方面完全改了個樣,不僅是神經細胞,還用到心肌細胞等各種各樣的細胞,都可以用Patch Clamp技術,來記錄電信號變化。發明該技術的人也得了諾貝爾獎。我預測有可能得諾貝爾獎的是人類基因研究中的自動測序技術,應用非常廣泛,而且許多工作可以提前好多年完成。這樣的技術、方法,可以說是一個非常好的工作。有時候被非常廣泛引用的技術性文章,還不一定是發表在Science、Nature雜志上,我們也不能用Science、Nature上發表論文的標準來衡量。比如Patch Clamp技術的文章就是發表在一個你可能都沒有聽說過的雜志上。
第三,Discoveries with obvious practical implications,過去在NIH有一中國人發表了一篇文章,發現了AIDS virus 的受體。那不得了,艾滋病毒可以進入人類免疫系統的細胞里,找到了受體,顯而易見就可以想辦法阻止它進入人類的免疫系統細胞, 根本不用去想,應用的前景顯而易見。又比如大家知道的老年癡呆癥,找到老年癡呆癥的基因,這樣就有可以及早預防和治療老年癡呆癥,否則無從入手。這樣的工作,如果你去看一本Science或Nature雜志的目錄,不需要看內容顯而易見就知道這工作是重要的。
第四,Conceptual breakthrough, 完全一個新的概念,過去人家不是這樣認為的一個概念上的突破。這里我不太謙虛舉一個例子,當時我們做神經營養因子引起很大的重視,神經營養因子一直是被認為起著促進神經細胞營養作用的如發育、分化。但從來沒有想到神經營養因子可以拿來調控突觸傳遞。突觸傳遞是學習記憶基本的細胞基礎,我們發現神經營養因子可以調控腦內突觸的可塑性,最終它也許可以調控學習記憶。這是我們96年發現的,當時被認為這是一個完全的新概念,當然現在已經被證實,逐漸開始想要應用到臨床上,而且在這領域進展很快。這樣一個概念方面突破,也是一個比較好的工作。
第五,Challenge to traditional views, break dogma,dogma是教課書已經建立一個理論體系,你要能夠打破它,證明是錯的,就很了不起。 這與上面講的是對應的,一個是能提出一個新的概念,另外是打破一個舊的觀念,就是說我要提出反對意見,原來的概念有問題,對它提出挑戰,提出這樣的問題,也是一個很好的工作。舉一個例子,我在90年代做博士后時,受了蒲慕明先生(現任中科院神經科學研究所外籍所長)很大的影響,他是我的老師, 我在做博士后時受了他很大的影響,今天講內容很多都是來自于蒲先生的影響。我就是從他身上學了非常多的怎樣做好的科學工作,他是非常杰出的科學家。舉個例子,我去美國沒多久,實驗室來了一位俄國的博士后,他是學物理的。當時實驗室的儀器大家都占滿了在用,他沒有儀器做實驗。所以蒲先生就拿了一本教科書讓他看看,說我們現在沒有時間同你討論課題。 他說我是來做實驗的,來做重大發現的,你怎么讓我看教科書,還是給我一個題目做實驗吧。蒲先生說,你有什么題目,他說我問你呢,你是導師,你要告訴我做什么題目。蒲先生說你沒有題目,那你來干什么?那就這樣吧,你看看教科書,看看哪里有錯,自己想個題目。 然后蒲先生拿了一本《細胞生物學》給他,讓他找錯,三個星期后再談。結果他天天在看,三個星期后蒲先生與他談,問他看出什么來了沒有,那位博士后說,我看是全對的。蒲先生說,教科書不一定是完全正確的,不要去相信權威,其實教科書上每一個概念,都是基于一到二個基本實驗或一二篇文章。你要想不出來的話,那我來給你想。大家都知道神經細胞的軸突,會生長出來,一個中學生就可以想象的問題,你要神經細胞越長越長,一定要有新的東西加進去,大家知道細胞有細胞膜,神經細胞要長,肯定要有細胞膜加進去,那細胞膜從那兒來的,這是一個基本問題,教科書上講,在長的時候,細胞里面有囊泡,這囊泡上面有膜,當囊泡到達軸突最前端的地方,它一融合fuse,膜就加上去了。也就是說膜是在軸突最前面的地方加上去的,這是教科書上的定論。蒲先生說,這個定論在教科書上就憑了一篇文章,做了一個實驗,說是看到膜是在軸突最前面,囊泡一fuse就加上去了。我們可以試一下這種觀點是不是對的,然后浦先生就給了這位博士后一臺給中學生看的,很差的小顯微鏡。這位博士后就把顯微鏡放在自己的辦公桌上,拿了一碟培養的神經細胞器皿看。看了大概一兩個月,看完以后他就開始寫paper, 我說你有這么容易嗎?然后再過了三個月左右,拿了臺好一點的顯微鏡,加了熒光打一打,做了一些非常簡單的實驗,真的就準備投稿了。我說你準備投那里,他說Science,我說就這玩意兒也可以投Science嗎?他說是蒲先生讓我投的。再過幾個月,他說我的paper接受了。這下我傻眼了,在這樣的顯微鏡下看看寫出來的文章居然會被Science接受? 請你給我講講,為什么這種工作可以發表在Science雜志上。他說這個實驗非常簡單,這是一個神經細胞,這里是細胞核,里面有囊泡,過去教科書上說囊泡在軸突最前端融合,軸突就變長了,越長越長。他說在細胞培養皿里面有灰塵樣臟東西,有時候灰塵粘在軸突上,你可以找到一個軸突上這里粘一個,那里粘一個,要是膜的囊泡不是在最前端融合,而是在兩個灰塵點之間融合,那么兩個灰塵點間的距離也可以增長,他每過五分鐘去量一量兩個灰塵間的距離,發現兩點之間的距離慢慢地增大了。后來我想了想他為什么會發表在Science雜志,主要是打破了傳統觀念,不是說教科書上的不對,而是也有例外。
第六,opening up new area,開創了一個嶄新的領域,也是從一個小事情做起,舉一個例子細胞凋亡現象的發現,細胞凋亡這是個很大的領域,發現這現象的幾位科學家在今后哪一年給他們諾貝爾獎是肯定的。這樣的一個領域,他們在發表第一、二篇文章的時候,提出了一個新的概念,開創了一個新的領域。原來認為細胞死亡是由于受傷等引起的被動過程,新的概念認為細胞的死亡不是一個被動的過程,而是一個主動的過程。因為生物個體需要某些細胞去死亡,某些細胞故意要去死亡,這就是一個主動過程。這概念一提出,許多工作就在此基礎上開展,開創了一個嶄新的領域。
在講完什么樣的工作是好的工作后,再講講什么樣的工作是不好的工作。我平時做很多雜志的評審工作,很多文章拿來給我評審,看的文章很多,總結出來幾點,什么樣的工作是不好的工作。
第一,Horizontal growth,叫做橫向長,這類文章在國內很多。如果一個人,要橫著長怎么也不會好看 (笑)。舉例,你在大鼠上得到一個發現,那我在小鼠上也做一下,也有同樣的發現,這就沒有創新意義。這個例子有點過分,當然如果你是在老鼠身上做,而在人身上從來沒有做過,我來做一下,那應該也是有意義的。
第二,Filling gaps,有人發現了A,猜想A會到B,有人發現了C,你就在中間證實一下A是通過B到C的。這樣的發現,也不是說不可以發表文章,但這種文章不會在很出色的雜志上發表,因為雜志的編委一看這種文章就認為是一種Filling gaps。舉例,已知EGF可以激活JNK,JNK可以造成C-Jun的表達,假如你發表一篇文章去說EGF可以促進C-Jun的表達,那人家已經知道JNK可以促進C-Jun的表達,EGF可以激活JNK,當然如果人家沒有做出來,這也是一種發現,但這種發現不是那么exciting,這類文章屬于填補空缺的文章。
第三,Working out details,有人把大的框架已經搞出來了,你把細節再搞清楚的文章,一般不會是特別好的文章。我今天講的不是壞文章,那我提也不提,只是講這類文章還可以在二流或三流雜志上發表,這是與前面講的好的工作有個反差。舉例,發現一個NO(一氧化氮)是個很重要的信號分子,發現者也得了諾貝爾獎。NO能產生cGMP,然后你做了一篇文章,說是用多少時間,怎樣的濃度,使NO產生cGMP,這類工作總是要有人去做,但這不會是一個最重要的貢獻。
第四,Support existing idea, “me too”,這類文章很多,有些人文獻看得很多,而且手腳特別快,等你的文章在Science、Nature上一發表,他馬上跟上一篇“me too”,你會,他也會。舉例,EGF受體吞噬時,需要dynamin, 已在Science雜志上發表,有人馬上發表PDGF受體也是需要dynamin,其實EGF-R與PDGF-R雖然受體完全不一樣,但都是個酪氨酸酶的受體,這兩個受體,你猜猜就可以知道。這種工作可以發表,但不會發表在最好的雜志,除非它在PDGF研究領域中有特殊意義。
第五,Follow up,有人在前面已經發表了,我在后面跟上。舉例,CREB是一個很重要的轉錄因子,它可以結合到DNA的一個成分上,這個成分叫CRE,這是一個很重大的發現,CREB可以結合到CRE,過二天他也發表一篇文章,一共需要幾個base,第一從哪里開始,最后到哪里結束,這里面到底要幾個堿基,A要多少個,要換掉的話binding就會不好。這種工作不是完全不重要,但屬于Follow up。
第六,Incomplete study, preliminary,這類文章最令人討厭,國內這樣的文章很多,歐洲也多,還有日本。做了二個圖或四個圖,有這么一點點的現象,故事還沒有講完,馬上就送去發表。這類文章在二三流雜志也不會拒絕,總歸是一個發現。這種把故事講了一半,你把現象搞掉了,使得人家也不能去做一個完整的工作。我覺得這種文章是阻礙了科學的發展,就象寫小說一樣,你寫了第一節,讓別人去寫第二、第三節,人家不會愿意去做。我是很討厭這類文章的,碰到這種文章,我做審稿時會讓他繼續去做,但不會拒絕,否則他會去投別的雜志。我會開個清單1,2,3,4,….,對他說,等你把這些工作全部做完,也會出一篇不錯的文章。我經常用這種方式來對待這類文章。在日本,在中國,很多人在壓力之下,都要在SCI幾點幾分雜志上發表文章,才可以拿博士學位。
在座的各位都是研究生,通過這堂課,要逐漸地學會培養自己對科學的欣賞能力。現在談一談怎樣閱讀科學文章。有誰能告訴我,你們是怎樣讀文章的(課堂上,有的說,先讀題目和摘要;有的說,先看材料和方法,再看結果;有的說,先看結果),我在讀研究生一年級的時候,一周上二堂分子生物學,二堂生化課。老師在每次講課時都給我們開一個十幾篇文章目錄,這些文章并不是短文章,都是很長的文章,每堂課前,我們先把文章拷貝好,然后用熒光筆把重要的內容畫好。給我們上課的教授,教我們一個方法,是哈佛大學Walter Gilbert發明的,Gilbert應發明DNA序列測試法,得過諾貝爾獎。他在給本科生講課時說,你們是怎樣讀Paper的,會讀Paper是你一輩子受用的事情,這Paper不能夠先看序言、方法,然后結果,即化時間又給它牽著鼻子走,這是很可怕的。寫文章的人就是要牽著你的鼻子看他的文章,讓你去相信他寫的東西,但你先不要去相信他,拿到文章后,先看題目、摘要,然后就去看圖1,因為結果都在圖里,不要借助任何幫助的情況下,先給圖1下一個你自己的結論,然后再看圖2,也下個結論,等到你把幾個圖都看完以后,再下個結論,然后去看文章,結果會發現你的結論經常與作者的結論不一樣,二個不一樣的結論,那總有一個是錯的,這時再去看文章,是你的錯,還是他的錯,也許你沒有看清楚那是你的錯,也許是他的解釋錯,這樣的話,你的收獲是很大的,而且速度也很快,不會被他牽著鼻子走。我評審文章一般不看討論,因為有誤導現象,專門領著你去上他的圈套,所以看Paper,首先了解他要探討怎樣一個問題,這是一個大框架,以及問題的重要性,假如是個吹毛求癡的小問題,who cares。然后用的實驗方法是否能夠回答這個問題,如一個分子在細胞里面是怎么動的,用光學顯微鏡是沒法看的,這肯定是胡說八道。一篇文章一定要有它的閃光的思想,如在一篇文章中有出人意料的新觀點,而且新的觀點是否有實驗結果來支持,如果實驗結果沒有支持新的觀點,那樣的文章要被拒絕。但是很多這樣的文章也照樣發表,所以你自己不一定要相信作者的觀點,自己要有自己的想法。
下面我想說,希望你們養成這樣一個習慣,每周閱讀CNS,你們知道CNS是什么意思,有人說是中樞神經系統(課堂上引起哄笑)。CNS是Cell、Nature、Science, CNS 每周出一期,要養成一個習慣瀏覽一下文章的目錄。我經常會問自己,為什么這篇文章會發表在CNS雜志上,如果能堅持一個學期下來,你必定會有很大的收益。我這個習慣是在讀研究生時養成的,每周我與幾位同學一起網上瀏覽,這周Nature、Science上發表了哪些文章,當然很多東西你不懂,偶爾有一個東西你懂,你就會問為什么它可以發表在Nature、Science上,久而久之,你就養成兩個習慣,一個是批判精神,很多已經發表在Nature、Science上的文章,都有漏洞,所以要學會批判。過去我念書的時候,老師講要是能找出論文的錯誤,你就及格了。有一次生化考試,內容是對發表在Scientific American雜志上的一篇文章找錯誤,Scientific American的文章往往是一個非常成熟的工作,一位非常有名的科學家寫在這個雜志上的文章,我們的考試是對發表在這個雜志上的一篇綜述找錯,這篇文章寫錯了,叫大家找。結果大家傻了,這有名的大雜志怎么會有錯,所以就是要有批判精神。另一種你要養成欣賞別人做得好的工作,如到音樂廳去聽音樂或到展覽館去欣賞藝術品一樣。其實做科學家是很有趣的,政府給你出錢,讓你玩,你如同每天在聽音樂,每天在看電影一樣,那有什么不開心的。
怎樣的科學工作是好的科學工作,如果今天我前面所講的內容你沒有聽進去的話,那現在講的內容是最重要的,這是貫穿于你每天的工作之中,你對人家要有這個要求,對自己更要有這樣的要求。沒有好的工作,再有寫作的技巧,也是沒用的。怎樣的工作算是好的工作?有三個基本要求,缺一不可。其一,必須被公眾認為是一個非常重要的科學問題,你一說出來大家都點頭這是重要的問題。其二,要有創新的概念,DNA的合成過程大家都知道是重要的,問題是怎樣在你的工作中體現出來。在蒲先生的實驗室里你寫實驗設計,蒲先生經常會問你兩個問題,第一,你想到的問題,你的競爭對手有沒有想到,如果他已經想到,那么就扔垃圾筒。第二,他沒有想到,是你想到的問題,但能發表在Nature、Science雜志上嗎?雖然科學工作不是以發表Nature、Science為目的,但是你的工作達不到這樣高的水平,那也要考慮是否要去垃圾筒。所以我們有好多這樣情況,文章投Science被拒絕,投Nature被拒絕,投Nature Neuroscience被拒絕,最后投Journal of Neuroscience也被拒絕了,碰到這樣的情況蒲先生會說,你有二個選擇,第一垃圾筒,第二你自己拿去,我的名字不要放上去。其三,如有一個非常重要的問題,而且別人想不到的,但能否過得了關,要看結果是不是可靠,結果是否被人信得過。這個問題怎么做呢?過去我在國內學習的時候,有一個我們十分崇拜的人,就是張香桐先生,你去看他的文章,他要闡明一個觀點,會從三至五個不同的方面來證明。他有一篇文章,發現下丘腦有一些神經元是痛敏感神經元,為了證明這一點,他工作做得很地道,針刺時放電會不會增加,不痛時放電會不會下降,針刺時,燒燒屁股會不會痛,從方方面面來加以證明。你說他的工作非常innovation或very, very important吧, 也不見得,但結果是非常可信的。我見過有的文章做了一種結果就投出去了,人家不會相信的,特別是重要的文章。我在斯坦福大學有位熟人,我知道我的很多文章在他手里敗下陣來。我問他,你是怎樣審文章的,他告訴我,他評審有一個基本原則,文章一到手第一反應是拒絕,然后再到文章中去找,找到足夠的證據來改變我的拒絕,我才考慮去接受,所以你的實驗結果一定要用多種方法、從多種角度,反反復復來證明。這是對得起別人,也對得起你自己。不要過二天人家認為你的文章是錯的,你會沒面子的,所以結果一定要非常可靠。如果你們的文章能符合這三個要求,進不了最好的雜志,那你來找我(笑)。
其實要做這三點對全世界搞科研工作的人來講都是件不容易的事情。在中國各種條件都比較差的情況下,我的加上第四點,你做的工作要unique and unusual, 就是要獨特非凡。你的科研工作一定要有自己的特色,你要能做出來的東西,人家做不來,而且是unusual的科研工作。舉例,我在哥侖比亞大學時,生物系有20多位教授,每年要招20多學生,然后學生可以選教授,選來選去,很多是考慮二個實驗室。一個實驗室,他做的是非常重要的問題,轉錄是怎么轉錄的,他把轉錄中的二十多個蛋白一個一個都克隆出來,它們之間的相互作用是怎樣的,他的工作很過硬,沒話可說,而且每篇文章都是很扎扎實實的,過硬的文章,發表層次很高。他的基本要求是,到他實驗室去的學生要畢業的話,不管你做多少年,要有三篇第一作者的文章,每篇文章的標準都訂得很高,所以這三篇文章的量很重。他的實驗室還有個基本情況,美國工作日每周五天,這與國內一樣,他說他每天晚上11點鐘回家,你如果每天要比他早回家的話,就不要到他實驗室去。他的lab meeting是星期天早上8:00, 那正好是睡懶覺時候,一開就是半天。他的實驗室是靠埋頭苦干,拼命用功,每人進實驗室時發一件棉襖,實驗室有一個很大的冷庫,在冷庫里一呆就是半天,純化蛋白。所以這個實驗室訓練很扎實,保證你有好的文章,如果想要早畢業沒門,至少在實驗室里要泡上6~7年,出來保證有好的出路,學生要是雄心勃勃的,會選擇他的實驗室。如果不想work very hard,你就不要去他的實驗室。另一個是蒲慕明先生的實驗室,這是截然不同的實驗室,平均每三個月換一個題目,有很好的idea, 做不出來就放棄,連續做到第6或7個題目,做順了,幾個月就結題,發個Nature文章。我后來仔細研究了一下這些文章,特點不是靠死打死拼,是靠自己有力的新穎的思想而取勝的,很多東西都是人家想不到的,一旦被你做出來一定是個創新性的工作。后來我與蒲先生談了這個事情,我說為什么你要選這樣題目,而不選辛辛苦苦地去做總會有結果的題目,他說做科學有二種人,一種叫紐約馬拉松,紐約馬拉松是全世界有名的,一年一次,你要贏這個馬拉松比賽,你要very good,要work very hard,拼命練習,肌肉很發達,還要起跑快,每個地方都不能失誤。這種科學家叫紐約馬拉松式的,本身條件好,又work very hard,而且起步快。第二種叫做紐約導游,導游在紐約或上海都有,一幫人后面跟著,他拿著一面小旗子,他指向哪兒,一幫人就跟到那兒。他認為這方向走錯了,再朝另一個方向走,大家跟著他走,他不用跑得很快。這種叫做紐約導游,要做一個另路人,要開創新的,不用跑得很快。最后我引用一句杜甫的詩句:語不驚人誓不休。他每個句子都讓人拍案叫絕,句句非常精彩。他不是隨隨便便就寫,也不是天才,但他每次想句子就想跟人家不一樣。
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