小細胞肺癌及其配對的正常肺組織差異表達蛋白質的雙相電泳2飛行時間質譜研究

摘要:目的　應用比較蛋白質組學方法分析小細胞肺癌( SCLC) 與其配對的正常肺組織差異表達蛋白質,為闡明SCLC 發病機制、篩選其早期診斷標志物提供有益的思路。方法　應用雙相電泳(22DE) 分離6 例SCLC 及其配對的正常肺組織可溶性總蛋白;應用基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(MALDI2TOF2MS) 獲得差異蛋白點的肽質量指紋圖譜( PMF) ;通過Mascot 軟件查詢NCBI 或SWISS2PROT 數據庫鑒定蛋白質。結果　每張圖譜約檢測到800 多個蛋白質點。經匹配分析,肺癌組織之間和正常肺組織之間凝膠圖像的匹配率分別為75. 5 %和78. 2 %;選擇14 個背景清晰、重復性及分辨率較好、蛋白表達差異明顯的點進行質譜分析,結合表觀分子量及等電點(p I) ,初步鑒定了11 種(六類) 蛋白質: ①與蛋白質降解通路有關的蛋白質:蛋白酶體α亞單位3 型、蛋白酶體β亞單位2 型及β亞單位5 型; ②自由基/ 抗氧化劑類:錳2超氧化物歧化酶(Mn2SOD) 、過氧化氫酶(CAT) 和黃素還原酶( FR) ; ③細胞骨架類:原肌球蛋白23 ( Tpm23) ; ④與能量代謝有關的蛋白質:硫氧還蛋白過氧化物酶( TPX1) ; ⑤分子伴侶:抑制素( PHB) ,內質網蛋白ER29 ( Erp29) ; ⑥其他:可溶性NSF 黏附蛋白(alpha SNAP) 。結論　應用22DE 及MALDI2TOF2MS 方法分離并初步鑒定了11 種(六類) 蛋白質;這些蛋白質與SCLC 發生發展密切相關,部分可能成為SCLC 診斷及治療的分子靶點。