食管與賁門雙源癌蛋白質指紋模型的建立及腫瘤標志的篩選
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下一篇 2009-01-01 19:36:45/ 個人分類:蛋白質
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【摘要】 目的:建立食管與
賁門雙源癌的
蛋白質組指紋診斷模型,篩選食管賁門雙源癌相關蛋白,為建立食管賁門雙源癌
腫瘤標志提供理論基礎。方法:采用表面增強激光解吸離子化飛行時間
質譜儀(SELDI2TOF2MS)
技術對19 例食管賁門雙源癌(雙源癌組)和50 位健康人(對照組)的血清進行蛋白質組的對比研究。根據差異性蛋白質的質核比(相對分子質量) 從SWISS2PROT 蛋白質數據庫中篩選并確定相關候選蛋白和
基因。并通過RT2PCR 方法進一步
分析這些關鍵候選基因在食管賁門雙源癌組織中表達變化特征。結果:以相對分子質量21866 21 ×103 、51103 30 ×103 、61597 65 ×103 、71931 55 ×103 、91311 96 ×103 和41113 99 ×103 的6 種蛋白質組成的決策樹模型對雙源癌組診斷的準確率、敏感度和特異度分別為78126 %、73168 %和80 %。相對分子質量為51340 52 ×103 和51921 32 ×103 的蛋白質查詢結果為COX7c 及Beta2defensin212223 ,在雙源癌的食管癌組織和賁門癌組織的陽性率分別為60 %(3/ 5) 、60 %(3/ 5) 、60 %(3/ 5) 和40 %(2/ 5) ,對照組食管和賁門正常上皮組織均為陰性。結論:以相對分子質量21866 21 ×103 、51103 30 ×103 、61597 65 ×103 、
71931 55 ×103 、91311 96 ×103 和41113 99 ×103 的6 種蛋白質組成的決策樹模型,可作為食管賁門雙源癌的蛋白診斷模型,COX7c 及Beta2defensin212223 與食管賁門雙源癌密切相關,為食管賁門雙源癌腫瘤標志篩選提供重要線索。
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TAG: 光譜法生物學腫瘤腫瘤標記蛋白質組學多原發性賁門