電泳基本原理
遷移率(或泳動度)是指帶電顆粒在單位電場強度下泳動的速度，可用下列公式計算：
U =υ/E =(d/t)/(V/l) =dl/Vt
U為遷移率(cm2?V-1?min-1);υ為顆粒泳動速度(cm?s-1);E 為電場強度( V?cm-1);d為顆粒泳動的距離(cm);l為濾紙有效長度(cm);V為實際電壓(V);t為通電時間(s或min)。通過測量d, l, V, t, 即可計算出被分離物質的遷移率。
1遷移率單位= 10-5 cm2?V-1?min-1在確定的條件下，某物質的遷移率為常數，是該物質的化學特征常數。 顆粒帶凈電荷多，直徑小而接近于球形，則在電場中泳動速度快，反之則泳動速度慢。
遷移率還與分子的形狀，介質粘度，顆粒所帶電荷有關，遷移率與顆表面電荷成正比，與介質粘度及顆粒半徑成反比。
影響瓊脂糖電泳遷移的主要因素
電場強度 溶液的pH值 溶液的離子強度 電滲現象 溫度的影響 支持物的影響
按分離原理分類：
1.區帶電泳 2.移界電泳 3.等速電泳 4.聚焦電泳
按有無固體支持物分類
1. 紙上電泳 2. 醋酸纖維素膜電泳 3. 薄層電泳
4. 非凝膠性支持物區帶電泳(支持物有：淀粉、纖維素粉、玻璃粉、硅膠)
5. 凝膠支持區帶電泳(淀粉凝膠、聚丙稀酰胺凝膠、瓊脂糖凝膠)
影響瓊脂糖電泳遷移的主要因素
DNA的大小 DNA的構象 瓊脂糖濃度 緩沖液 不同構像質粒
緩沖液 TAE：乙酸鹽緩沖液 TBE：硼酸鹽緩沖液 TPE：磷酸鹽緩沖液
實驗操作
1. 用膠帶將洗凈、干燥的水平板的邊緣封住，形成一個膠模并水平放置。
2. 按水平板的長×寬×0.5cm膠厚，量取0.5×TBE，并按0.7%的濃度稱取agarose瓊脂糖，在微波爐或電爐上加熱至全熔(清澈透明)。
3. 等凝膠溫度降至大約50-60以下時，加入1 mg/L溴化乙錠(EB)至終濃度為0.5ug/mL ;搖勻并輕快地倒入水平板中，除掉氣泡，插入梳子。
4. 凝固后，將梳子輕輕拔出。
5.去掉膠帶，將水平板放入加有0.5×TBE電泳緩沖液的電泳槽中，并且使電泳緩沖液高出凝膠約1mm。
6.在parafilm膜上依次加： ddH2O 6ul,上樣Buffer 2ul ,DNA 4ul 分別混勻后點樣，記錄點樣次序。
7. 在水平板兩邊的點樣孔中分別加入6 μ l的λΔΝΑ/EcoRI+HindIII marker。
8. 蓋好電泳槽蓋子，選擇適當的電泳電壓(≤5V/cm)及電泳方向(DNA陰極陽極)，開始電泳。
9. 當色素接近膠的先端，停止電泳，樣品在紫外燈下觀察、成像℃