雙向
凝膠電泳是將不同種類的
蛋白質按照等電點和分子量差異進行高分辨率分離的分析方法。成功的二維電泳可以將2000到3000種蛋白質進行分離,是目前唯一的同時能分離成百上千種蛋白質的工具。通過對蛋白質雙向電泳的圖譜掃描,用相關軟件(PDQUEST等)進行圖譜差異分析,找到差別點。然后把差別點切出,進行脫色、酶解。最后樣品進入
質譜測試,得到質譜原始數據文件。通過搜庫可得到差別點蛋白質的詳細信息。
原理:
1、根據蛋白質的等電點(第一向)和分子量(第二向)的不同進行分離。
2、電泳后根據蛋白質的上樣量對膠進行考馬斯亮蘭染色、銀染或熒光染色,然后用相關軟件對電泳圖象進行分析。
樣品要求:
1、建議使用的蛋白質溶解體系為8M 尿素/4%CHAPS /40mMTris(Base)/65mM DTT;
2、樣品濃度大于2 ug/ ul;
由于
蛋白質組學涉及的樣品范圍很廣,對于具體樣品的要求請和項目經理聯系。
1st dimension:
IEF: IPG-PhorII (GE) and Protean IEF (BioRad)
Bio-Rad Model 111Mini IEF Cell
2nd dimension:
GE Ruby SE600 (16x16cm)
GE Ettan DALTsix (26x20cm)
BioRad Criterion pre-cast (13x9cm)
BioRad Protean (8.6x7cm)
2D凝膠圖像識別軟件
Image master 2D Elite?
實例分析