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  • 電泳遷移實驗 EMSA

    上一篇 / 下一篇  2008-08-25 00:58:46/ 個人分類:電泳實驗

    1、核蛋白的提取

    ①用 細 胞 刮子刮取RAW264.7細胞與VSMC,移入2.5mlEP 管中。②將細胞用冰冷PBS洗兩遍,于4℃, 5000g離心3min,沉淀細胞。③加5倍細胞體積的冰浴緩沖液A洗細胞一次,于4℃,5000g離心3 min沉淀細胞.④加3倍細胞體積的冰浴緩沖液A懸浮細胞,冰上放置30 min、劇烈振蕩10次,4℃,5000g離心15min,去上清,沉淀為細胞核。⑤加與細胞等體積的冰浴緩沖液B,充分混勻,冰上放置30m in后,于40℃ ,15 000g離心15min,上清為核蛋白。⑥取2ul核蛋白Bradford法測定核蛋白濃度,分裝后于-70℃保存。

    2.探針的標記與純化

    A、 探 針 的標記:將以下試劑加入冰浴中的0.5m l的EP管中,總體積20時。①未標記的探針:2ul (50ng);② 10 x激酶緩沖液:2g1;③ [y-32P]ATP: 4ul (40 uCi); ④T4多聚核甘酸激酶:lul (10U);⑤超純水:11ul。

    B.混勻后37℃水浴30分鐘;

    C、加入5u1 1%SDS/100 mM EDTA短暫渦旋混勻,以終止激酶反應;

    3、探針的純化

    ①準 備 MicroSpin' G25分離柱;②輕輕渦旋分離柱以重懸管內樹脂;③將蓋子擰松1/4后去掉管底密封;④將分離管放入一只1.5mlEP管中(EP管作支撐用)⑤ 735g離心l分鐘;⑥加入樣品:⑦分離管放入一只新的1.5 mlEP管中,緩慢將樣品加入樹脂床角度平面的中央,735g離心1分鐘;⑧將75ul超純水加入分離柱,735g離心1分鐘;⑨收集支撐管內純化好的探針,小心丟棄分離管。

    4,測定探針的放射活性

    取1ul純化的探針,用閃爍計數器測量其放射活性,放射活性大于1* 10 5cpm/ul示標記成功。

    5,凝膠遷移阻滯法測定NF-KB

    A、 按下 列 順序分別將各反應成分加入第一套做好標記的EP管內:①結合緩沖液:4ul ②穩定液D: 2 ul;③核提取物:lug;④去離子水至:16ul.

    B、用移液槍輕輕吸打混勻,4 0C下將核提取物預孵育20分鐘,

    C、在核提取物預孵育期間,按下列順序依次將各成分加入做好標記的第二套EP管內:①結合緩沖液:2ul;②穩定液D:1ul;③探針:lul;④去離子水:4ul。

    D、將探針棍合物加入預孵育好的核提取物混合物中,用移液器輕輕吸打混勻后,4℃繼續孵育20分鐘。

    E,EMSA測定:預先將5%非變性丙烯酞胺膠(38:2 )和電泳緩沖液(1X TGE)預冷至4℃,然后:①將每反應管內所有反應物加入樣品孔中。同時在一空白孔中加入含溟酚藍的上樣緩沖液,以觀測膠的移動情況。當溟酚藍電泳至玻璃板下1/3即可停止電泳(約2小時)。②電泳:12.5V/cm(16cm玻璃板為200V)a

    F、放射自顯影:電泳完畢后,取出凝膠,用保鮮膜封好;將凝膠與放入有增感屏的曝光盒中,于一70℃ 放射自顯影24小時。然后將X光片在顯影液中顯影30sec-1min,在定影中定影15-30min,清水沖洗干凈后自然晾干。

    G、圖像分析:將各測量組的電泳照片掃描至計算機,然后應用Bandscan分析軟件對電泳條帶進行灰度測定,并計算平均光密度值(OD),以各條帶的OD值表示相應核轉錄因子的活性


    TAG: 實驗電泳遷移

     

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