本方法適用于蛋白質和多肽的C 端序列分析不包括C-端被修飾或突變的情況。C 端是蛋白質及多肽一個重要的結構和功能部位很多蛋白質的活性位點在C 端C 端氨基酸的降解突變或修飾將顯著影響其高級結構和生物活性此外在基因工程產品的質控中C 端序列也是一個重要指標結合 N 端序列測定和質譜法精確測定分子量可以闡明分子的完整性C 端序列分析方法有早期的肼解法僅能測得 C 端一個氨基酸羧肽酶法其 C 端氨基酸的釋放是一個動態演繹過程不夠準確且操作繁瑣另外一個間接的方法是二階微分光譜法分離分析 C端肽并測定全序列樣品蛋白的 C 端附近必須含有色氨酸上述方法效率不高 或操作不便而難以成為常規 C 端序列分析方法