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  • 2D PAGE:DIGE 熒光差異蛋白表達分析

    上一篇 / 下一篇  2008-08-02 22:09:26/ 個人分類:蛋白質(組)項目服務

    Ettan DIGE熒光差異蛋白表達分析系統在傳統雙向電泳技術的基礎上,結合了多重熒光分析的方法,在同一塊膠上共同分離多個分別由不同熒光標記(Cy2,Cy3,Cy5)的樣品,并第一次引入了內標的概念,極大地提高了結果的準確性,可靠性和重復性。在DIGE技術中,每個蛋白點都有它自己的內標,并且軟件全自動根據每個蛋白點的內標對其表達量進行校準,保證所檢測到的蛋白豐度變化是真實的。DIGE技術可檢測到樣品間小于10%的蛋白表達差異,統計學可信度達到95%以上。利用Ettan DIGE技術還可以對微量(少到5μg)樣本進行蛋白質組學分析。
     
    原理:
     
    在Biomedical Node of the Australian Proteome Analysis Facility的網站中有關于DIGE原理的動畫。如有興趣,可以從以下鏈接瀏覽http://www.proteomics.usyd.edu.au/movies/dige.swf
        
    DIGE的工作流程如下:


    優點:
    1、相對于2D,在檢測大量樣品時,由于不同樣品可以跑同一塊膠,大大減輕了工作量。
    2、檢測靈敏度更高  Detection Limit = 125 pg protein,大大節約了樣品,特別是不易得到的珍貴樣品。
    3、檢測動態范圍更大—Dynamic range 104 -105
    4、內標歸一化 —— 采用內標而消除了膠與膠之間的差異造成的誤差
    5、統計學分析—— 利用DeCyder軟件可以得到統計學可信的結果,極大降低操作者之間的偏差,并且將手工操作時間減少到幾分鐘。
     
    1st dimension:
    IEF: IPG-PhorII (GE) and Protean IEF (BioRad)
    2nd dimension:
    GE Ruby SE600 (16x16cm)
    GE Ettan DALTsix (26x20cm)
    BioRad Criterion pre-cast (13x9cm)
    BioRad Protean (8.6x7cm)
    Data acquisition:
    GE Typhoon 9400 Scanner
    Analysis software:
    GE DeCyder for DIGE gels

    TAG: digeettan雙向電泳熒光標記蛋白表達

     

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