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如果是單酶切,超螺旋質粒會變成開鏈DNA,開鏈的DNA在凝膠中泳動速度慢于超螺旋質粒,因此條帶會偏大,這是酶切充分的情況。如果不充分,就會有大小有差距的幾條帶;
如果是雙酶切,而且片段大小適中,可以看見酶切的片段和載體,還有未切開的質粒。
能不能區分超螺旋質粒和開鏈質粒,和所用瓊脂糖凝膠的濃度,電泳時間,DNA純度有關。試著延長跑膠的時間,應當是有區別的。酶切之前就有幾條帶,可能是因為質粒樣品中有雜帶,來源于雜菌或者降解。
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