如何分析real time PCR的數據結果
學習做Realtime PCR, 實驗結果是出來了,得到的內參、目的基因的Ct 值在15-25 之間,熔
融曲線基本上也是單峰,但不太會處理這個結果,對著數據發愁.不同的處理方法得到不
同的結果.
做的是相對定量,SYBR Green, 選用2^(-△ △ Ct)法
內參基因:對照組1、對照組2、對照組3
實驗組1、實驗組2、實驗組3
目的基因:對照組1、對照組2、對照組3
實驗組1、實驗組2、實驗組3
數據處理的時候,是先分別取內參、目的基因的三次平行實驗的均值再拿相應均值相減得到
還有對于內參基因的數據,如果所得Ct 值差值在1 以內,是否可以將所有的內參取平均,
另外對于這個REAL-TIME PCR 的結果除了用EXCEL 處理之外有沒有其他比較可信方便的
內參基因: 18s for control, 18s for treatment sample
目的基因: control sample, treatment sample
復孔取平均值
△ Ct for control sample = Ct of comtrol sample - Ct 18s for control
△ Ct for treatment sample = Ct of treatment sample - Ct 18s for treatment sample
△ △ Ct = △ Ct for treatment sample - △ Ct for control sample
2^(-△ △ Ct)
2^(-△ △ Ct) =1 means miRNA expression no change
2^(-△ △ Ct) 1 means expression increase after treatment