結合亞硫酸氫鈉處理和酶解分析(COBRA) ? ??? 亞硫酸氫鈉處理的DNA 擴增后使甲基化的胞嘧啶殘基成為胸腺嘧啶，而已經甲基化的胞嘧啶殘基仍維持胞嘧啶。這種變化會產生新的酶切位點或保持原有的甲基化依賴位點。PCR反應的引物中不包含CpG二核苷酸，因此與模板和原來的甲基化位點不會混淆。在此之后，將PCR產物純化、酶切、聚丙烯酰胺凝膠電泳、電印跡、單核苷酸雜交和磷圖像定量。 ? ??? COBRA是一個測定DNA甲基化敏感的定量方法，在檢測完全甲基化和完全不甲基化的樣品時最常用。在甲基化變異細胞占少數的混雜的樣品中，由于所用鏈特異性PCR不是特異擴增變異靶序列，故靈敏度較MSP差。