油菜RNA的提取方法
1.取新鮮植物葉片0.1g(研磨樣品前可用水或酒精清洗樣品)于2mL離心管中,在液氮或-80℃下貯存。 2.研磨: 在樣品研磨前,提取液[飽和酚︰(0.1mol·L-1LiCl、100mmol·L-1 Tris-HCl PH8.0、10mmol·L-1 EDTA、1%SDS)=1︰1]于80℃浴預熱,加入前,提取混合液上下顛倒混勻。 3.提取: (1) 加入500μL80 提取液,30s渦流混勻; (2) 加入250μL氯仿︰異戊醇(24︰1),30s渦流混勻; (3) 置于冰上。 4.沉淀: (1) 離心:12000rpm,4℃,5min。 (2) 預處理:300μL的4M LiCl(相當提取液的一半)。 (3) 取樣品水相與LiCl 按1︰1混合(如溶液混濁可再離心)。 (4) 沉淀:混合液于-20過夜。 (5) 收集:12000rpm,4℃,15min。 5.分離: (1) 棄上清,可剩余少量殘留, (2) 加100μL的DEPC水,用吸管上下混勻溶解沉淀。 (3) 加入10μL的3 mol·L-1 NaAc(pH5.2)和200μL的95%乙醇。輕緩渦流幾秒,RNA儲于-20℃或-70℃過夜。 6.洗滌: (1) 12000rpm,4℃,15min, 棄上清。 (2) RNA沉淀用70%乙醇洗滌,12000rpm,4℃,5min后輕棄上清,旋轉吸取液體。 (3) RNA于通風櫥放置15min風干,并確保無水進入。 7.懸浮: 12μL的DEPC水溶解沉淀,儲于-20℃或-70℃。 RNA提取完成后,利用瓊脂糖凝膠檢測RNA質量。 瓊脂糖變性膠的制備:2.4g瓊脂糖,150mL水,20mL的10×mops緩慢加熱至沸(小心溢出)。冷卻至50℃,加入30mL甲醛,總量200mL。 樣品處理: (1)、2μL RNA懸浮液(0.5μg·μL-1); (2)、3μL 變性緩沖液(10×mops︰甲醛:甲酰胺=1︰1.5︰5); (3)、0.6μL LB(1mmol·L-1 EDTA pH8.0 ,50%甘油,0.25%溴酚藍,0.25%混二甲苯)。 混合后置于65℃干浴5min后于冰上。 上樣混合液按①︰②︰③=1︰1.5︰0.3比例混合。 1μL的RNA上樣混合液可在加熱前/后加入,電解液為1×mops,并且高于稍膠面,電壓小于500mA。 (責任編輯:大漢昆侖王) |