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    RNA提取的一般步驟:各種方法的匯總

    關鍵詞: rna 提取 步驟來源: 互聯網

    RNA提取原理: 通過變性劑破碎細胞或者組織,然后經過氯仿等有機溶劑抽提RNA,再經過沉淀,洗滌,晾干,最后溶解。但是由于RNA酶無處不在,隨時可能將RNA降解,所以實驗中有很多地方需要注意,稍有疏忽就會前功盡棄。所有RNA的提取過程中都有五個關鍵點,即:樣品細胞或組織的有效破碎;有效地使核蛋白復合體變性;對內源RNA酶的有效抑制;有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;對于多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質的有效除去。但其中最關鍵的是抑制RNA酶活性。RNA的提取目前階段主要可采用兩種途徑:提取總核酸,再用氯化鋰將RNA沉淀出來;直接在酸性條件下抽提,酸性下DNA與蛋白質進入有機相而RNA留在水相。第一種提取方法將導致小分子量RNA的丟失,目前該方法的使用頻率已很低實驗步驟:破碎組織&rarr;分離RNA&rarr;沉淀RNA&rarr;洗滌RNA&rarr;融解RNA&rarr;保存RNA。1、破碎織和滅活RNA酶可以同步進行,可以用鹽酸胍、硫氰酸胍、NP-40、SDS、蛋白酶K等破碎組織,加入&beta;-ME可以抑制RNA酶活性。 2、分離RNA一般用酚、氯仿等有機溶劑,加入少量異戊醇,經過此步,離心,RNA一般分布于上層,與蛋白層分開。 3、沉淀RNA一般用乙醇、3M NaAc(pH-5.2)或異丙醇 4、洗滌RNA使用70%乙醇洗滌,有時,為避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗滌之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能過于干燥,否則不易溶解。 5、融解RNA一般使用TE。 6、保存RNA應該盡量低溫。為了防止痕量RNase的污染,從富含RNase的樣品(如胰臟、肝臟)中分離到的RNA需要貯存在甲醛中以保存高質量的RNA,對于長期貯存更是如此。從大鼠肝臟中提取的RNA,在水中貯存一個星期就基本降解了,而從大鼠脾臟中提取的RNA,在水中保存3年仍保持穩定。另外,長度大于4kb的轉錄本對于痕量RNase的降解比小轉錄本更敏感。為了增加貯存RNA樣品的穩定性,可以將RNA溶解在去離子的甲酰胺中,存于-70℃。用于保存RNA的甲酰胺一定不能含有降解RNA的雜物。來源于胰臟的RNA至少可以在甲酰胺中保存一年。當準備使用RNA時,可以使用下列方法沉淀RNA:加入NaAc至0.3M,12,000×g離心5分鐘。氯化鋰法提取總RNA:本方法用高濃度尿素變性蛋白并抑制RNA酶,用氯化鋰選擇沉淀RNA,其特別適合于從大量樣品中提取少量組織RNA,具有快速簡潔的長處,但也存在少量DNA的污染及RNA得率不高,小RNA片斷丟失的缺陷。試驗試劑:1.氯化鋰/尿素溶液【氯化鋰126g(3M) 尿素、360g(6M) 加水至1L,過濾滅菌】2.懸浮液【10mM Tris-HCL (pH7.6) ,1mM EDTA (pH8,0) ,0.5%SDS】試驗步驟: 1、 對于大量組織或細胞,則每克組織或細胞加入5-10ml氯化鋰-尿素溶液,勻漿器高速勻漿2分鐘;對于少量細胞(107個細胞/ml),則每克組織或細胞加入0.5ml氯化鋰-尿素溶液手工勻漿,并轉移至Eppendof管中。 2、勻漿液在0-4℃放置4小時后,12000g離心30分鐘。 3、取沉淀,加入原勻漿液1/2體積的氯化鋰-尿素溶液,重復步驟2。 4、沉淀用原勻漿液1/2體積的氯化鋰-尿素溶液復溶后,加入等體積酚/氯仿/異戊醇在室溫放置15-30分鐘并不時搖動混勻,4000g離心5分鐘。 5、取上層水相,加1/10倍體積的3M乙酸鈉(pH5.2)及2倍體積的乙醇,-20℃放置1小時,5000g離心。 6、70%乙醇洗沉淀一次。真空干燥。 7、RNA溶解液溶解沉淀,得RNA,分裝,于-70℃保存。蛋白酶-熱酚法* 本方法適合于病毒RNA的提取 試驗試劑: 1、蛋白酶K(終濃度50ug/ml) 2、2×緩沖液:1%SDS 20mMTris-HCL (pH 7.6) 0.2M NaCL+ 試驗步驟: 1、提純病毒液中加入等體積緩沖液、蛋白酶K,37℃40-50分鐘。 2、加入等體積65℃預熱的酚溶液,輕徭,在65℃保溫5分鐘后再輕徭。 3、離心,取上清,氯仿抽提一次。 4、取上層水相,加1/10倍體積的3M乙酸鈉(pH5.2)及2倍體積的乙醇,-20℃放置1小時,5000g離心(10000g,10min)。 5、70%乙醇洗沉淀一次。真空干燥。 6、RNA溶解液溶解沉淀,得RNA,分裝,于-70℃保存。RNA提取一般步驟總結

    (責任編輯:大漢昆侖王)
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