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    BAC提取方法

    關鍵詞: BAC來源: 互聯網

    BAC提取前準備(前兩天 )

    配制含25 mg/l Kan的LB培養基選擇平板,在超凈工作臺上用接種環從購買的BAC劃線接種至選擇平板,于37℃培養箱培養過夜,供選擇單。

    BAC提取前準備(前一天)

    1、在超凈工作臺上,用50 μg/ml Kan和液體LB培養基配制成25 mg/l Kan培養基,每個Falcon試管分裝10 ml。也可先分裝10 ml無抗生素的液體LB培養基后,然后每管中加5 μl濃度為50 μg/ml Kan溶液。

    2、在培養皿中標出三個單克隆 (不要太大,不要太小),用牙簽挑取第1個單克隆 一半,在的的小培養皿固體LB培養基(分裝10 ml,含25 mg/l Kan)上劃一橫線,標上序號;接著用同一根牙簽挑取第1個單克隆 的另一半接種到剛配制好的液體培養基中。

    第2、3個單分別用牙簽挑取在同一個小培養皿固體LB培養基上劃一橫線,分別標上序號。

    3、接種的固體培養基置于37℃培養箱過夜。接種到Falcon試管中的E.coli 進行液體振蕩培養(37℃,240 rpm)20小時。

    BAC提取(第二天)

    將緩沖液P1按要求加入RNase A,置于冰上。緩沖液P3也置于冰上。取出適量緩沖液QF在65℃條件下預熱。其他緩沖液在常溫下保存。

    1、接種的固體培養基從37℃培養箱中取出,用包裝膜封好后置于4℃條件下貯存。取液體振蕩培養的Falcon試管到超凈工作臺中,在微量離心管中分裝300 μl的E.coli 和300 μl 30%glycerol的LB培養基,用移液器上下吹吸混勻,置于-80℃貯存。

    2、將Falcon試管在室溫條件下2700 rpm離心20 min。丟棄上清,將沉淀置于冰上。

    3、在0.6 ml緩沖液P1中重懸細菌沉沉小球。邊吹吸邊攪動,混勻而不要出塊菌塊,然后全部轉移到2 ml 微量離心管中。

    4、加入0.6 ml緩沖液P2,上下倒置數次,輕輕混和,在室溫下培養5 min。

    5、加入0.6ml冰冷的緩沖液P3,立即上下倒置數次,輕輕混和,在冰上培養5 min。

    6、用微量離心器在最大速度下(13000 rpm)離心10 min。此時可支起過濾架,標好QIAGEN-tip 20尖管。

    7、利用1 ml緩沖液QBT對QIAGEN-tip 20尖管進行平衡處理,讓其在重力作用下從柱中流出。

    8、將離心后的上清倒入QIAGEN-tip 20尖管,讓其在重力作用下進入樹脂。

    9、用4 ml緩沖液QC對QIAGEN-tip 20尖管進行清洗2次,每次用2 ml。

    10、清洗后將1.5 ml或2 ml微量離心管置于QIAGEN-tip 20尖管頭下,用0.8 ml預熱的緩沖液QF分兩次稀釋DNA 。每次0.4 ml。

    11、用0.7體積(每0.8 ml稀釋體積用0.56 ml)的isopeopanol在室溫下沉淀DNA 。立即用微量離心機中在13000 rpm 轉速下離心30 min。

    此步以后在離心機上操作要注意離心管的放置方向,保持沉淀方向一致或作好標記。以利于用移液管移吸上清,不會攪動沉淀。另外,抽吸剩下少量(約50 ml)溶液可再離心一次,之后全部吸出上清。

    12、用1 ml 70%酒精加入微量離心管中(洗滌DNA ),在13000 rpm 轉速下離心5 min。先用移液器從沉淀小球對面移去大部分酒精,抽吸剩下少量(約50 ml)溶液再置于13000 rpm 轉速下離心5 min。然后移出酒精,在通風處或超凈工作臺送風條件下風干,但不宜過干,過干很很難溶解。

    13、用20 μl TE緩沖液(pH 8)溶解DNA ,置于冰上,每10 min 彈擊微量離心管,以促進DNA 溶解。之于置于4℃條件下過夜。

    14、第三天可將DNA 取出,在60℃條件下預熱一小時,每10 min 彈擊微量離心管,以促進DNA 溶解。之后在1%的瓊脂糖膠上鑒定。

    推薦方法

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