PCR剪接VHCDR3基因文庫和VL基因構建scFv基因文庫
[器材和試劑]
Winard PCR純化試劑盒 (Promega)
PCR試劑和設備
用于連接scFv和pHENl DNA以及將scFv文庫電轉化到大腸桿菌TGl株的試劑和設備 FDSEQ引物
擴增的VHCDR3基因文庫和VL基因,
[方法]
1. 配制4個25ulPCR反應液,包含:
去離子水,10.25ul
10×Vent緩沖液,2.5ul
20×dNTP(每種5mmol/L), 1.25ul
VH文庫DNA(200ng),l 0ul
VL基因DNA(200ng), 5.0ul
VentDNA聚合酶(2單位),1.0ul
在有加熱蓋PCR儀中以94℃1.5分鐘、65℃1.5分針、72℃1,5分鐘無擴增循環7次,連接片段。
2. 7次循環后,保持在94℃,添加含有旁側引物的25ul混合液:
去離子水,15.2ul
10×Vent緩沖液,2.5ul
20×dNTP(每種5mmol/L), 1.3ul
FdSEQ引物 (10pmol/u1), 2.5ul
LMB3引物(10pmmol/ul),2.5ul
VentDNA聚合酶(2單位),1.0ul
3. 以94℃1分鐘、42℃1分鐘、72℃2分鐘的條件共循環30次,剪接片段。用Wlnard PCR純化試劑盒純化PCR產物。
4. 用NcoI和NotI消化PCR產物。
5. 將消化的PCR產物連接到NcoI/NotI消化的pHENl中,并電轉化到大腸桿菌TGl細胞,用于VHCDR3多樣化的引物定位和設計。
VHCDR3多樣化所需引物是根據擬親和力成熟抗體的V基因序列進行設計的。例中,VHCDR3(下劃線區域)中7個氨甚酸被隨機化。框架3 (FR3)末端和框架4(FR4)起始端用實線標出