瓊脂糖電泳步驟之超級基礎篇
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一、電泳前準備
準備內容 | 作用 |
1. 刷干凈電泳制膠的梳子,板子,槽子,蒸餾水洗凈晾干 | 防止不必要的重復污染,減少外來的污染。梳子干凈有利于梳孔的形成。 |
2. 檢查電泳槽,根據情況更換buffer | 排除電泳槽的電極接觸不良,確保buffer 的緩沖能力,減少污染。 |
3. 根據DNA 的分離范圍選擇合適的膠濃度并記錄 | 達到較好的分離效果,防止樣過快跑出膠或者是過慢浪費時間。 |
4. 計算agarose 的用量和制膠 buffer 的用量記錄,膠最終越薄越好。 | 實驗記錄備查 |
二、制膠
步驟 | 注意事項 |
1. 稱量agarose 和buffer | Buffer 不要用成H2O ,稱量相對準確 |
2. 融膠,加熱到膠產生大量的氣泡時,拿出搖勻,繼續加熱到完全溶解,拿出搖勻,再加熱到沸騰。 | 非常熱,小心燙手,另外注意不要加熱過度使膠沖出瓶子。因此注意選擇起碼為膠體積2 倍以上的瓶子。保證膠混勻和完全溶解,減少可能因此引起的膠中孔徑不均勻影響分離效果。 |
3. 倒膠,可用水浴的辦法使膠冷卻到60 度左右,即手可以握住瓶子的溫度,沿著制膠板的一側,緩緩地一次性倒入。梳子最好是預先放好并固定的,注意梳孔的體積能點的下所有的樣。用槍頭趕掉氣泡。 | 制膠的桌面相對水平。倒膠時盡量減少氣泡的產生。EB 如果在制膠時加入,在60 度左右時加入,使終濃度為0.5ug/ml 。不宜過低,染色成像不明顯;不宜過高,導致背景太深。搖勻要沿著瓶壁搖動,盡量減少氣泡產生的可能性。高濃度膠例如2% 以上的EB 很難搖勻,而且凝的速度也相對快,強烈建議跑完膠之后再用EB 染色。 |
4. 室溫凝膠30 分鐘 | 過程中不要碰到梳子,盡量保持膠的位置不移動。時間不宜過久,導致膠干燥變形;不宜過短,影響膠內部孔徑形成。 |
5. 拔梳子,放入電泳槽。 | 緩緩地將梳子垂直從梳孔拔出,盡可能使梳子是同時從各個膠孔拔出的。暫時不用的膠最好放入電泳槽電泳液中浸泡。電泳液要浸沒膠1mm 。 |
三、上樣電泳
步驟 | 注意事項 |
1. 樣品中加入loading buffer 使其終濃度為1 X ,混勻 | Loading buffer 濃度不宜過低,點樣時樣品不能很好的沉在膠孔里;不宜過高,電泳時容易形成帶形的變形。注意混勻。 |
2. 點樣 | 沿著膠孔的邊緣勻速加入。盡量避免碰壞膠孔。槍頭不要吸過多的氣泡,拔起時不要過猛帶出樣品。每點一個樣完,吸取buffer 洗槍頭,避免樣品混雜。如果是有特殊要求,例如回收,強烈建議每點一個樣換一次槍頭。加樣的速度當然是越快越好,注意保證質量。點樣的量不要太大,一方面是體積不要太大,溢出污染鄰位樣品;一方面兩不要太大,容易導致脫尾和模糊不清。 |
3. 接通電源,選擇合適的電壓和時間電泳。 | 膠孔與電極成水平狀態,防止樣品跑歪。跑膠期間不時回來看看,防止樣品跑出膠等意外發生。 |
四、染色成像
步驟 | 注意事項 |
1. 染色 | 如果膠中沒有加入EB ,用0.5ug/ml 的EB 溶液浸染30 分鐘。 |
2. 調整鏡頭的拍攝范圍和焦距,成像 | ? |
3. 打印照片做分析記錄 |
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