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    凝膠遷移實驗系列二-實驗操作方法

    關鍵詞: 凝膠 遷移來源: 互聯網

      1.探針的標記:

      (1) 如下設置探針標記的反應體系:

      待標記探針 (1.75pmol/微升) 2微升

      T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) 1微升

      Nuclease-Free Water 5微升

      [γ-32P]ATP(3,000Ci/mmol at 10mCi/ml) 1微升

      T4 Polynucleotide Kinase (5-10U/微升) 1微升

      總體積 10微升

      按照上述反應體系依次加入各種試劑,加入同位素后,Vortex混勻,再加入T4 Polynucleotide Kinase,混勻。

      (2) 使用水浴或PCR儀,37℃反應10分鐘。

      (3) 加入1微升探針標記終止液,混勻,終止探針標記反應。

      (4) 再加入89微升TE,混勻。此時可以取少量探針用于檢測標記的效率。通常標記的效率在30%以上,即總放射性的30%以上標 記到了探針上。為實驗簡便起見,通常不必測定探針的標記效率。

      (5) 標記好的探針最好立即使用,最長使用時間一般不宜超過3天。標記好的探針可以保存在-20℃。

      2.探針的純化:

      通常為實驗簡便起見,可以不必純化標記好的探針。在有些時候,純化后的探針會改善EMSA的電泳結果。如需純化,可以按照如 下步驟操作:

      (1) 對于100微升標記好的探針,加入1/4體積即25微升的5M醋酸銨,再加入2體積即200微升的無水乙醇,混勻。

      (2) 在-70℃至-80℃沉淀1小時,或在-20℃沉淀過夜。

      (3) 在4℃,12000g-16000g離心30分鐘。小心去除上清,切不可觸及沉。

      (4) 在4℃,12000g-16000g離心1分鐘。小心吸去殘余液體。微晾干沉淀,但不宜過分干燥。

      (5) 加入100微升TE,完全溶解沉淀。標記好的探針最好立即使用,最長使用時間一般不宜超過3天。標記好的探針可以保存于-20℃。

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