Orbitrap Exploris平臺FAIMS-DIA蛋白質組學快速定量分析

2023-06-29

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摘要

數據非依賴性采集（Data-Independent Acquisition，DIA）是當前

蛋白質組學中應用范圍較廣的定量方式。DIA掃描模式中，超高分

辨質譜將一級質譜的質荷比范圍分為若干窗口，快速地對特定質量

范圍內所有母離子進行碎裂并采集碎片離子。相比于傳統的DDA方

法，DIA定量有更好的重現性及準確性，DIA也更加適用于大隊列定

量蛋白質組學研究[1]。

作為應用于大隊列的定量蛋白質組學研究策略，擁有一個更高效更

穩定的解析平臺尤為重要。Orbitrap Exploris系列質譜是賽默飛世

爾科技公司從 2019 年推出的全新靜電場軌道阱超高分辨質譜儀平

臺，采用全新的設計，讓儀器具有更佳的性能和更高的穩定性，

并且能夠兼容FAIMS Pro接口，進一步提高檢測靈敏度和抗污染能

力。本文使用 Orbitrap Exploris 480質譜，對Hela細胞蛋白質組和

血漿蛋白質組進行DIA及FAIMS-DIA定量分析，考察 Orbitrap Explo-

ris 480的DIA定量能力。

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