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蛋白質組學研究是系統式鑒定、定量蛋白質,并全景式研究蛋白質
功能的學科。隨著學科的進步,對于自下而上(Bottom-up)蛋白
質組學的分析深度的需求不斷增加。蛋白質組學的分析深度可顯著
影響人們對于生理、病理過程的理解,以及影響早期診斷的生物標
志物的發現等領域,而隨著精準醫學等應用方向的研究不斷深化,
則需要更高靈敏度更高分辨率的分析手段。在蛋白質組學的發展歷
程中,基于毛細管色譜柱的納升液相聯合高分辨質譜的成功應用,
使得蛋白質組學研究以超高的靈敏度、極小的上樣量為其特點而著
稱,可在質譜端獲得幾千甚至上萬蛋白的鑒定深度。這些優異性能
也極大的拓寬了蛋白質組學技術在生命科學領域的應用范圍。
在反相液相色譜的分析中,為實現對較低豐度多肽的鑒定,通常需
要使用更長的色譜柱以提供更高的色譜峰容量,而較長的色譜柱也
對于色譜耐受壓力提出了更高的要求[1-2]。
本文我們以全新一代可耐壓1500 bar的Vanquish Neo UHPLC 液相
色譜搭載Orbitrap Exploris 480高分辨質譜儀,測試了不同長度的色
譜柱在不同梯度內對Hela細胞裂解液的鑒定能力,同時也考察了全
新的FAIMS Pro Duo在此色譜-質譜組合中的鑒定提升能力。