Real-Time Search實時檢索助力Orbitrap Eclipse實現TMT 高通量精準定量

2023-06-29

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摘要

TMT標記定量是蛋白質組學多重定量分析研究中使用最廣泛、也是

功能最強大的研究策略，有實驗周期短、檢測通量高、缺失值少等

優點，目前TMT標記已經可以同時完成最多18個樣品的定性定量。

這項技術面臨的主要挑戰為，共隔離肽段的干擾和MS2譜圖中共碎

裂導致定量精度的折損。為了解決這一挑戰，在Orbitrap Fusion和

Orbitrap Fusion Lumos “三合一”系列質譜SPS-MS3方法的基礎

上，賽默飛基于2019年新推出的Orbitrap Eclipse質譜，開發了一種

稱為RTS-SPS-MS3（RTS，Real Time Search，實時檢索）[1]的新

技術。

本文中，我們借助Thermo Scientific? Pierce? TMT11plex yeast酶

解肽段標準品、摻入6種蛋白質消化物的TMT10plex標記的細胞或

血漿樣品、酵母和去高豐度血漿混合樣品，評估了Orbitrap Eclipse

質譜儀特有的RTS-SPS-MS3 TMT定量方法的通量和定量準確度。

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