問:什么是QPCR?
答:QPCR的英文全名是Real-time Quantitative PCR Detecting
System。即實時熒光定量核酸擴增檢測系統,也叫實時定量基因擴增熒光檢測系統,簡稱QPCR。
問:QPCR、DNA檢測、PCR之間的關系?
答:聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain
Reaction簡稱PCR)原理憑借敏感、特異、快速的特點榮獲93年諾貝爾化學獎。因其在病原體檢測方面的獨特優勢,因而發達國家在相關方法和儀器方面的研發非常快,成為分子生物學診斷的主流,至今仍處于學術和應用前沿:
第一代產品:
基因擴增熱循環儀(DNA Thermal Cycler)+電泳儀+紫外分析儀+定性試劑,構成PCR定性檢測。
第二代產品:
基因擴增熱循環儀+熒光儀+終點定量試劑,構成PCR-DNA終點法定量檢測(End-point quantitative PCR
detection),又分為終點酶免定量( End-point ELISA-PCR)和終點熒光定量(End-point Fluor-PCR)兩種。
第三代產品:
實時定量QPCR儀+實時熒光定量試劑,構成QPCR-DAN/RNA實時熒光定量檢測。
問:相比以前的方法,QPCR有哪些特點?
答:QPCR至少有以下特點:
- 所用儀器少,只用一臺儀器。
- 檢測時間短,只須45分鐘~1小時10分鐘(試劑各異),而定性PCR須3~4小時,酶免終點定量須5~6小時,熒光終點定量須2~3小時。
- 操作極其簡單:前處理后,樣本插入儀器一小時后到電腦上來出報告即可,無須開蓋,移樣本(以前方法),避免污染。
- 結果精確:定性PCR只能定性,很粗略,終點定量PCR由于只能在40個熱循環結束后檢測熒光,被測熒光達到飽和導致定量不夠精確,屬于半定量狀態。而實時熒光QPCR是在擴增的每時每刻連續檢測各樣本的熒光值的變化。
問:QPCR的技術先進性、價格及應用現狀?
答:實時熒光QPCR是當今世界用于臨床的最先進核酸分子診斷技術,被美國FDA承認并推崇,被美國FDA批準并取得臨床應用執照的QPCR試劑品種有:
- HBV乙肝病毒DNA,
- HCV丙肝病毒RNA,
- HIV愛滋病病毒RNA,
- Chlamydi trachomatis(CT),性傳播疾病,沙眼衣原體,
- Neiserria gonorrhea (NG),性傳播疾病,淋病雙球菌,
- Cytomegalovirus(CMV),性傳播疾病,巨細胞病毒,
- Mybobacterium tuberculosis(Mtb),呼吸道疾病,結核分支桿菌等。
實時熒光PCR儀研發技術難度大,門檻高,發達國家也只有有限幾家知名公司生產,且售價昂貴:如
- 羅氏公司 LightCycler 480
- 德國eppendorf 公司 Mastercycler ep realplex 實時熒光定量PCR儀
- BIO-RAD公司 iQ5實時PCR檢測系統
- 美國ABI 7500 Real-Time PCR System
- 美國ABI 7000 Sequence Detection System Spare Parts
- 美國ABI 7900HT Fast Real-Time PCR System
以上產品價格在50萬上下不等。
可見,在病人看來,哪家醫院應用了QPCR技術便是先進診斷技術的象征,在發達國家也是如此。
國產儀器情況:國產儀器生產單位不超過五家,其中包括:
- 日本獨資杭州博日實時熒光QPCR儀(33孔)
- 西安天隆科技有限公司實時熒光QPCR儀(48孔)
以上產品均取得國家SFDA認證,報價均在30萬以內。
國產試劑情況:
多家公司生產實時熒光QPCR試劑盒,價格與終點法試劑相當,且品種齊全,價格便宜,購買方便:
- 乙肝HBV-DNA,
- 丙肝HCV-RNA,
- 艾滋AIDS HIV-RNA,
- 性病系列:淋病雙球菌NG, 沙眼衣原體CT,
- 解脲支原體UU, 皰疹病毒HSV,
- 人體乳頭瘤HPV,
- 優生優育系列:巨細胞病毒CMV,弓形蟲COX等。
問:QPCR的應用領域
答:QPCR主要應用在醫療檢驗、疾病防控、食品安全、農業、林業、畜牧養殖、水產養殖、分子生物、法醫鑒定、科研探究等諸多領域。
據不完全統計相關國家標準強制要用QPCR儀進行檢測:
《2004GB/T 194380.1-禽流感病毒通用熒光 RT-PCR檢測方法》
《SN/T 1632.3-2005 奶粉中阪崎腸桿菌檢驗方法:熒光PCR方法》
《SN/T 1870-2007 食品中致病菌檢測方法:實時PCR法》
《GBT 21105-2007 動物源性飼料中狗源性成分定性檢測方法 PCR方方法》
《GBT 21102-2007 動物源性飼料中兔源性成分定性檢測方法 實時熒光PCR方法》
《GBT 19915.8-2005 豬鏈球菌2型毒力因子熒光PCR檢測方法》
《GBT 19495.4-2004 轉基因產品檢測 核酸定性PCR檢測方法》
《SNT 1686-2005 新城疫病毒中強毒株檢測方法 熒光RT-PCR法》
《SN 0169-1992 出口食品中大腸菌群、糞大腸菌群和大腸桿菌檢驗方法》