蛋白質分離純化一條街:凝膠過濾層析
凝膠過濾層析(Gel Filtration Chromatography,GFC)又稱
尺寸排阻層析(Size Exclusion Chromatography,SEC)
凝膠滲透層析(Gel Permeation Chromatography,GPC)
分子篩層析(Molecular Sieve Chromatography,MSC)
注:在高效液相色譜分析中,用GFC或SEC表示凝膠過濾色譜或尺寸排阻色譜,流動相通常是水溶液;在有機高分子分析中,常用GPC表示凝膠滲透色譜,流動相通常是有機溶劑;在蛋白質分離純化中用GFC或SEC表示凝膠過濾層析或尺寸排阻層析;本文以下內容均針對蛋白質分離,因此均以凝膠過濾層析(GFC)表示。
(1)分離機理
GFC填料是由高分子交聯而成、內部具有網狀篩孔的固體顆粒,利用球狀凝膠內的篩孔的大小,不同水力學半徑的分子在通過填料時運行路徑存在差異,利用該差異將不同大小的蛋白質進行分離。
蛋白質分子流過填充凝膠的管柱時,大分子無法進入凝膠篩孔,而只流經凝膠及管柱間的孔隙,因此總體運行路徑較短,從層析柱入口到出口所需時間較短;較小的分子因為進入凝膠內的篩孔,總體運行路徑較長,故在管柱內的停留時間較長;基于此原理可以區分大小不同的分子,亦可與已知大小的分子作比較而確定未知樣品的分子量。
注1:球形蛋白與線性分子在凝膠過濾層析中的保留行為存在差異,因此使用球形蛋白制作的分子量標準曲線不能用于明膠多肽、淀粉或其它聚合物。


(2)應用范圍
A 蛋白質分離,基于混合中不同蛋白質分子尺寸大小進行分離;
B 分子量測定,蛋白質分子量(球形)的對數與其在凝膠過濾層析時的保留時間呈線性關系;
C 樣品脫鹽或溶劑置換。
(3)填料要求
一般狀況下,用于制備凝膠過濾層析的填料應不吸附目標成份,所有欲分離物質均被洗脫出,這是凝膠層析法與其它層析法不同的地方。凝膠的材質需為化學惰性,與分離物不能產生變性(denature)或是其它化學反應,最好具有能長期反復使用的穩定性,并可以在較大的pH和溫度范圍內使用。凝膠要有一定的機械強度,在層析過程中才不會變形,增加機械強度也可使層析在較高壓力的環境進行,縮短分離時間。
(4)凝膠過濾常用填料種類
目前常用的凝膠包括3個主要類型:
A:葡聚糖凝膠(Polydextran),商品名稱是Sephadex
Polydextran幾乎不溶于溶劑中,親水性強,能迅速在水和電解質溶液中膨脹,在堿性的環境中十分穩定,所以可以用堿去除凝膠上的污染物。
Sephadex G-X,X表示葡聚糖的交聯程度,數值越大則交聯度越小,但吸水量越高,X值大致是吸水量的10倍。以Sephadex G-25為例,表示1克干燥的G-25凝膠可以吸水2.5 ml。
Sephadex的分離范圍與填料粒經和交聯度密切相關,大概范圍如下:
型號 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質)
G 10 55-166 <700
G 15 60-180 <1500
G 25 - 1000-5000
G 50 - 1500-30000
G 75 - 3000-80000
G 100 - 4000-150000
G 150 - 5000-300000
G 200 - 5000-600000
Superdex屬于葡聚糖以共價結合到交聯多孔瓊脂糖珠體上的球形凝膠,流速快、反壓低。
型號 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質)
Superdex 30 24-44 <10000
Superdex 75 24-44 3000-70000
Superdex 200 10000-600000
B 聚丙稀酰胺凝膠(Polyacrylamide)
Polyacrylamide是一種合成凝膠,商品名Bio-Gel P,干粉顆粒狀。依膠的分離范圍不同,分成Bio-Gel P-2至Bio-Gel P-300,P后面的數字乘以1000為最大過濾限度。Polyacrylamide的化學性質不活潑,但它在極端的pH下會被水解,水解后產生的COOH-具有離子交換的性質,因此pH 值應盡量控制在2-10之間。
型號 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質)
Bio-Gel P-2 - <1800
Bio-Gel P-4 - 800-4000
Bio-Gel P-6 - 1000-6000
Bio-Gel P-10 - 1500-20000
Bio-Gel P-30 - 2500-40000
Bio-Gel P-60 - 3000-60000
C 瓊脂糖凝膠
商品名稱Sepharose,由屬于天然凝膠,依凝膠中干膠的百分含量,分為Sepharose 2B,4B和6B。Agarose gel 是一種大孔凝膠,主要用于像核酸或病毒這些分子量400,000以上的物質,因其顆粒軟,在分離過程有時會阻塞管柱,造成流速減慢,又因其在攝氏50度以上會融化,故需于較低溫的環境中進行層析。Agarose 做成beads后不能再脫水干燥,所以要在濕態中保存。
經2,3-二溴丙醇反應交聯而成的凝膠為Sepharose CL型凝膠
型號 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質)
Sepharose 2B 70000-40000000
Sepharose 4B 60000-20000000
Sepharose 6B 10000-4000000
Sepharose CL-2B 70000-40000000
Sepharose CL-4B 60000-20000000
Sepharose CL-6B 10000-4000000
Superpose 瓊脂糖經多次交聯形成的凝膠。
型號 粒度(微米) 有效分離范圍(球形蛋白質)
Superose 6 5000-5000000
Superose 12 1000-300000
其它凝膠:聚丙稀酰胺葡聚糖凝膠,交聯聚苯乙烯凝膠,聚乙烯醇凝膠等,還有更多新型號的凝膠。
4 操作實例(轉載)
1) 凝膠溶脹
凝膠顆粒要求大小比較均勻 ,可流速穩定,結果較好。取葡聚糖Sephardex G-75干粉,加過量的蒸餾水室溫充分溶脹一天(溶脹時間因凝膠交聯度不同而不同),或沸水浴中溶脹3小時,這樣可大大縮短溶脹時間,而且可以殺死細菌和霉菌,并可排出凝膠內氣泡。溶脹過程中注意不要過分攪拌,以防顆粒破碎。待溶脹平衡后用傾瀉法除去不易沉下的細小顆粒,最后凝膠經減壓抽氣除去氣泡,即可準備裝柱。