蛋白質在溶液中構象轉換的分子動力學模擬

摘要: 將蛋白質的穩定和失活、折疊和去折疊等現象概括為蛋白質分子在溶液中的構象變化問題。采用非晶格模型和Langevin 分子動力學方法研究了無限稀釋溶液及不同尺度和不同表面親/ 疏水性球形限制性空間內β模型蛋白的構象分布及其轉換特性。模擬結果顯示:尺寸適度的疏水性空間有利于蛋白質結構發生縮塌,而親水性空間有利于縮塌態蛋白質結構的穩定,且表面親/ 疏水性的影響作用隨著空間半徑的增大而減弱。計算結果與實驗報道一致,為研究蛋白質分子在溶液中的折疊和穩定化提供了理論工具。