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  • 求解HP 模型蛋白質折疊問題的改進PERM算法

    上一篇 / 下一篇  2008-12-31 20:08:13/ 個人分類:蛋白質

    • 文件版本: V1.0
    • 開發商: 本站原創
    • 文件來源: 本地
    • 界面語言: 簡體中文
    • 授權方式: 免費
    • 運行平臺: Win9X/Win2000/WinXP
    摘 要 PERM 是一種用來求解基于HP 模型蛋白質折疊問題的高效算法1 在介紹PERM 算法核心思想的基礎上,對影響算法效率的因素做了改進:重新定義了權重和權重預測公式,并對選擇動作時不同情況下的權重計算公式進行了統一,得到了改進的PERM 算法1 對當前文獻中的多個典型算例進行了測試,并與Monte Carlo 算法和PERM 進行了比較1 結果表明, 改進后的PERM 算法在計算速度上比PERM 有明顯提高,在速度和優度上遠高于Monte Carlo 算法1 特別是對鏈長為46 的算例,找到了比文獻中報道的結果能量更低的構形1



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    TAG: hpperm模型算法蛋白質折疊增長型算法

     

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