基因和蛋白質的批量注釋系統UBROAD

摘要: 以DNA 微陣列、二維電泳、二維高壓液相色譜和質譜等技術為代表的轉錄組和蛋白質組高通量實驗技術,能夠產生海量的基因或蛋白質數據,對這些基因或蛋白質的注釋是對相關數據進行后期處理的基礎和必要條件. 海量數據的注釋人工難以完成,而目前基因和蛋白質的批量注釋網站給出的注釋又往往不夠全面. 在比較常用基因和蛋白質的批量注釋網站的基礎上,本工作研發了基因和蛋白質的批量注釋系統UBROAD(Unified Batch Retriever ofAnnotation Data) ,該系統整合了NCBI、Swiss2Prot 、BINDenzyme - expasy、gene2accession 和gene2Unigene 6 個有關基因和蛋白質的數據源; 支持UniprotPtrEMBL AC、Uniprot Entryname、Genbank Protein Accession Number、Genbank mRNA gi、Genbank mRNA Accession Number、Genename、Gene ID 和Unigene ID 8 種登錄號混合查詢;含有各種登錄號以及基因或蛋白質的基本信息、功能分類、相互作用共38 項注釋項供選擇;提供微軟電子表格形式的注釋結果. 可以通過訪問網頁http :PPwww. bioscience. org. cnPubroad 免費使用該系統.