基于P2HP 平臺的蛋白質折疊分布式計算

摘 要：通過對基于格點模型的PERM 算法進行定性分析，提出并行化計算PERM 算法的策略。該策略保存了PERM 算法中最關鍵的平均權重向量，并分發至多個計算單元進行模擬運算，從而達到減少計算時間、提高運算結果精確度的目的。以P2HP 為計算平臺，對多條蛋白質序列進行模擬運算。實驗結果表明，基于PERM 的蛋白質折疊并行計算方法能夠在P2HP 平臺上獲得較優的性能。