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  • 蛋白質相互作用網絡中信號通路的識別算法

    上一篇 / 下一篇  2008-10-25 13:27:51/ 個人分類:蛋白質

    • 文件版本: V1.0
    • 開發商: 本站原創
    • 文件來源: 本地
    • 界面語言: 簡體中文
    • 授權方式: 免費
    • 運行平臺: Win9X/Win2000/WinXP
    摘 要: 基于分枝限界方法,提出了QuickPathWay(QPW) 算法來預測蛋白信號通路. 該算法使用蛋白質網絡中節點間的距離作為約束條件來進行雙向搜尋,減少了多余中間節點數. 實驗表明,QPW 算法能夠在5 min 內找到長度為8 的絲裂原活化蛋白激酶(MAPK) 信號通路,其他較短的信號通路的查詢時間不超過1 min. 本實驗同時也驗證了QPW算法的可靠性. QPW算法與其他研究者的類似算法相比速度更快.



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    TAG: 信號通路

     

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